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南美巨脂鲤(霍尔姆贝格,1887年)的完整线粒体基因组序列

Complete mitochondrial genome sequence of Piaractus mesopotamicus (Holmberg, 1887).

作者信息

Pimentel Juliana da Silva Martins, Carmo Anderson Oliveira do, Maciel Danielle de Cássia Lima, Siqueira Flávia de Faria, Kalapothakis Evanguedes

机构信息

a Departamento de Biologia Geral , Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais , Belo Horizonte , Brazil and.

b Instituto Federal de Minas Gerais, Campus Betim , Betim , Brazil.

出版信息

Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 May;27(3):1940-1. doi: 10.3109/19401736.2014.971297. Epub 2014 Oct 16.

Abstract

The migratory species Piaractus Mesopotamicus, popularly known as the pacu, was determined to have a complete mitochondrial genome of 16,722 bp with 45% GC content. The genome contained 13 protein-coding genes (PCGs), 2 rRNA genes, 22 tRNA genes, and a 1048 bp Control Region (D-loop). Almost all the PCGs used the standard ATG start codon, except for Cox1 that used a GTG start codon. Five of the 13 PCGs had a TAA stop codon, two had the incomplete stop codon TA- (Atp6 and Cox3), and five had the incomplete stop codon T-- (Nd2, Cox2, Nd3, Nd4, and Cytb). AGG was the stop codon of Cox1.

摘要

洄游性物种美索不达米亚锯脂鲤,俗称帕库鱼,其线粒体基因组全长16722 bp,GC含量为45%。该基因组包含13个蛋白质编码基因(PCGs)、2个rRNA基因、22个tRNA基因以及一个1048 bp的控制区(D环)。几乎所有的蛋白质编码基因都使用标准的ATG起始密码子,但细胞色素c氧化酶亚基1(Cox1)使用GTG起始密码子。13个蛋白质编码基因中有5个使用TAA终止密码子,2个使用不完全终止密码子TA-(ATP合酶亚基6(Atp6)和细胞色素c氧化酶亚基3(Cox3)),5个使用不完全终止密码子T--(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基2(Nd2)、细胞色素c氧化酶亚基2(Cox2)、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基3(Nd3)、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基4(Nd4)和细胞色素b(Cytb))。AGG是Cox1的终止密码子。

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