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苹果酸高产菌株禾本科黑粉菌RK089的基因组草图序列

Draft Genome Sequence of Ustilago trichophora RK089, a Promising Malic Acid Producer.

作者信息

Zambanini Thiemo, Buescher Joerg M, Meurer Guido, Wierckx Nick, Blank Lars M

机构信息

Institute of Applied Microbiology (iAMB), Aachen Biology and Biotechnology (ABBt), RWTH Aachen University, Aachen, Germany.

BRAIN AG, Zwingenberg, Germany.

出版信息

Genome Announc. 2016 Jul 28;4(4):e00749-16. doi: 10.1128/genomeA.00749-16.

DOI:10.1128/genomeA.00749-16
PMID:27469969
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4966473/
Abstract

The basidiomycetous smut fungus Ustilago trichophora RK089 produces malate from glycerol. De novo genome sequencing revealed a 20.7-Mbp genome (301 gap-closed contigs, 246 scaffolds). A comparison to the genome of Ustilago maydis 521 revealed all essential genes for malate production from glycerol contributing to metabolic engineering for improving malate production.

摘要

担子菌纲黑粉菌Ustilago trichophora RK089可从甘油产生苹果酸。从头基因组测序揭示了一个20.7兆碱基的基因组（301个缺口封闭的重叠群，246个支架）。与玉蜀黍黑粉菌521的基因组比较发现了从甘油生产苹果酸的所有必需基因，这有助于进行代谢工程以提高苹果酸产量。