• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

植物代谢组学中的数学建模方法

Mathematical Modeling Approaches in Plant Metabolomics.

作者信息

Fürtauer Lisa, Weiszmann Jakob, Weckwerth Wolfram, Nägele Thomas

机构信息

Department of Ecogenomics and Systems Biology, Faculty of Life Sciences, University of Vienna, Vienna, Austria.

Vienna Metabolomics Center, University of Vienna, Vienna, Austria.

出版信息

Methods Mol Biol. 2018;1778:329-347. doi: 10.1007/978-1-4939-7819-9_24.

DOI:10.1007/978-1-4939-7819-9_24
PMID:29761450
Abstract

The experimental analysis of a plant metabolome typically results in a comprehensive and multidimensional data set. To interpret metabolomics data in the context of biochemical regulation and environmental fluctuation, various approaches of mathematical modeling have been developed and have proven useful. In this chapter, a general introduction to mathematical modeling is presented and discussed in context of plant metabolism. A particular focus is laid on the suitability of mathematical approaches to functionally integrate plant metabolomics data in a metabolic network and combine it with other biochemical or physiological parameters.

摘要

对植物代谢组进行实验分析通常会产生一个全面的多维数据集。为了在生化调控和环境波动的背景下解读代谢组学数据,人们已经开发出各种数学建模方法,且已证明这些方法很有用。在本章中,将对数学建模进行一般性介绍,并结合植物代谢进行讨论。特别关注数学方法在功能上整合植物代谢组学数据于代谢网络中并将其与其他生化或生理参数相结合的适用性。

相似文献

1
Mathematical Modeling Approaches in Plant Metabolomics.植物代谢组学中的数学建模方法
Methods Mol Biol. 2018;1778:329-347. doi: 10.1007/978-1-4939-7819-9_24.
2
Mathematical Modeling of Plant Metabolism in a Changing Temperature Regime.在不断变化的温度环境下植物代谢的数学建模。
Methods Mol Biol. 2020;2156:277-287. doi: 10.1007/978-1-0716-0660-5_19.
3
Using metabolome data for mathematical modeling of plant metabolic systems.利用代谢组学数据对植物代谢系统进行数学建模。
Curr Opin Biotechnol. 2018 Dec;54:138-144. doi: 10.1016/j.copbio.2018.08.005. Epub 2018 Sep 5.
4
Integration of Plant Metabolomics Data with Metabolic Networks: Progresses and Challenges.植物代谢组学数据与代谢网络的整合:进展与挑战
Methods Mol Biol. 2018;1778:297-310. doi: 10.1007/978-1-4939-7819-9_21.
5
Regression-Based Modeling of Complex Plant Traits Based on Metabolomics Data.基于代谢组学数据的复杂植物性状的回归建模
Methods Mol Biol. 2018;1778:321-327. doi: 10.1007/978-1-4939-7819-9_23.
6
Solving the differential biochemical Jacobian from metabolomics covariance data.从代谢组学协方差数据中求解微分生化雅可比矩阵。
PLoS One. 2014 Apr 2;9(4):e92299. doi: 10.1371/journal.pone.0092299. eCollection 2014.
7
Translational Metabolomics of Head Injury: Exploring Dysfunctional Cerebral Metabolism with Ex Vivo NMR Spectroscopy-Based Metabolite Quantification头部损伤的转化代谢组学:基于体外核磁共振波谱的代谢物定量分析探索脑代谢功能障碍
8
Metabolomics in Plant Priming Research: The Way Forward?植物激发研究中的代谢组学:未来之路?
Int J Mol Sci. 2018 Jun 13;19(6):1759. doi: 10.3390/ijms19061759.
9
Elementary flux modes, flux balance analysis, and their application to plant metabolism.基本通量模式、通量平衡分析及其在植物代谢中的应用。
Methods Mol Biol. 2014;1083:231-52. doi: 10.1007/978-1-62703-661-0_14.
10
Plant metabolomics: from experimental design to knowledge extraction.植物代谢组学:从实验设计到知识提取
Methods Mol Biol. 2013;1069:279-312. doi: 10.1007/978-1-62703-613-9_19.

引用本文的文献

1
Optimization of the incubation parameters for biogenic synthesis of WO nanoparticles using Taguchi method.采用田口方法优化生物合成WO纳米颗粒的孵育参数。
Heliyon. 2022 Sep 15;8(9):e10640. doi: 10.1016/j.heliyon.2022.e10640. eCollection 2022 Sep.
2
Dynamics of Plant Metabolism during Cold Acclimation.植物在低温驯化过程中的代谢动力学。
Int J Mol Sci. 2019 Oct 30;20(21):5411. doi: 10.3390/ijms20215411.