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推定的膦酸盐生产者菌株I6的全基因组序列,该菌株从印度尼西亚红树林沉积物中分离得到。

Complete Genome Sequence of the Putative Phosphonate Producer sp. Strain I6, Isolated from Indonesian Mangrove Sediment.

作者信息

Krause Janina, Ratnakomala Shanti, Lisdiyanti Puspita, Ort-Winklbauer Regina, Wohlleben Wolfgang, Mast Yvonne

机构信息

Department of Microbiology/Biotechnology, Interfaculty Institute of Microbiology and Infection Medicine, Faculty of Science, Eberhard Karls University of Tübingen, Tübingen, Germany.

Research Center for Biotechnology, Indonesian Institute of Sciences (LIPI), Cibinong, Indonesia.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2019 Jan 24;8(4). doi: 10.1128/MRA.01580-18. eCollection 2019 Jan.

DOI:10.1128/MRA.01580-18
PMID:30701253
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6346202/
Abstract

Streptomyces sp. strain I6 is a novel strain isolated from an Indonesian mangrove sediment sample. Bioinformatic analysis of the genome sequence of Streptomyces sp. I6 revealed 23 biosynthetic gene clusters. One of them encodes the synthesis of a putative phosphonate secondary metabolite, a class of underexplored natural compounds with great pharmaceutical potential.

摘要

链霉菌属菌株I6是从印度尼西亚红树林沉积物样本中分离出的一种新菌株。对链霉菌属I6的基因组序列进行生物信息学分析,发现了23个生物合成基因簇。其中一个编码一种假定的膦酸盐次级代谢产物的合成,膦酸盐是一类尚未充分探索但具有巨大药用潜力的天然化合物。