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建立一个单细胞基因组实验室。

Setting Up a Single-Cell Genomic Laboratory.

作者信息

Mamanova Lira

机构信息

Wellcome Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge, UK.

出版信息

Methods Mol Biol. 2019;1979:3-8. doi: 10.1007/978-1-4939-9240-9_1.

DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_1
PMID:31028628
Abstract

Transcriptomics has been revolutionized by massive throughput RNA-seq. To date, the ongoing decrease in sequencing cost and recent eruption of single-cell related protocols have boosted a demand for single-cell RNA sequencing projects. Although the single-cell RNA-Seq (scRNA-Seq) approach is close to the conventional "bulk" RNA-seq, several features that are unique to scRNA-seq should be taken into consideration in order to obtain high-quality libraries and unbiased sequencing data.In this chapter I give recommendations for setting up the single cell-suitable laboratory environment.

摘要

转录组学因大规模高通量RNA测序而发生了变革。迄今为止,测序成本的持续下降以及近期单细胞相关方案的涌现,推动了对单细胞RNA测序项目的需求。尽管单细胞RNA测序(scRNA-Seq)方法与传统的“批量”RNA测序相近,但为了获得高质量文库和无偏倚的测序数据,仍应考虑scRNA-Seq独有的几个特征。在本章中,我将给出关于建立适合单细胞研究的实验室环境的建议。

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