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1981年沃纳的完整线粒体基因组(黑珊瑚目:多枝黑珊瑚科)。

The complete mitochondrial genome of Warner, 1981 (Antipatharia: Myriopathidae).

作者信息

Figueroa Diego Francisco, Hicks David, Figueroa Nicole Jewel

机构信息

School of Earth, Environmental, and Marine Sciences, University of Texas Rio Grande Valley, One West University Boulevard, Brownsville, TX, USA.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Nov 20;4(2):4109-4110. doi: 10.1080/23802359.2019.1692701.

DOI:10.1080/23802359.2019.1692701
PMID:33366341
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7707681/
Abstract

Specimens of the black coral were collected from the Northwestern Gulf of Mexico. The complete mitochondrial genome of one of these specimens was obtained from genomic DNA by next-generation sequencing technology on the Illumina HiSeq 2500. Only three species of black corals have a completely sequenced mitochondrial genome. These were used to reconstruct the phylogeny for the order Antipatharia. The mitochondrial genome of is 17,712 base pairs and contains 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNAs, and 2 transfer RNAs in the following order: 16s RNA, , (with intron), , , , , , , and (with intron and copies of and ), , , , , . The gene arrangement is the same as that for with a nearly identical sequence (99.35% identical). These results show that the mitochondrial genome within the family Myriopathidae is highly conserved.

摘要

黑珊瑚样本采集自墨西哥湾西北部。其中一个样本的完整线粒体基因组通过Illumina HiSeq 2500上的下一代测序技术从基因组DNA中获得。只有三种黑珊瑚拥有完全测序的线粒体基因组。这些被用于重建角珊瑚目的系统发育。其线粒体基因组为17712个碱基对,包含13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA和2个转运RNA,顺序如下:16s RNA、、(含内含子)、、、、、、、和(含内含子以及和的拷贝)、、、、、。基因排列与的相同,序列几乎相同(99.35%相同)。这些结果表明,多枝珊瑚科内的线粒体基因组高度保守。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0806/7707681/32eb0d85c3f8/TMDN_A_1692701_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0806/7707681/32eb0d85c3f8/TMDN_A_1692701_F0001_B.jpg
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