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杨梅科叶绿体全基因组的特征分析与系统发育分析

The characterization and phylogenetic analysis of complete chloroplast genome in (Myricaceae).

作者信息

Guan Yuanlin, Wang Pengkai, Qie Hongli, Huang Yinghong, Yu Wensheng

机构信息

Taihu Extension Center for Evergreen Fruit of Jiangsu Province, Suzhou, China.

College of Horticulture, Vegetable Genetics and Breeding Laboratory, Anhui Agricultural University, Hefei, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jan 11;6(1):66-68. doi: 10.1080/23802359.2020.1845997.

Abstract

The first complete chloroplast genome of was obtained by illumina platform sequencing technology in this study. The size of genome is 158,943 base pairs, consist of a pair of IRs 26,043 bp in length, the LSC region of 88,167 bp and SSC region of 18,690 bp. The genome has 112 unique genes, among which 79 protein-coding genes, 29 tRNAs, and 4 rRNAs. Phylogenetic analysis revealed that clustered with within Myricaceae.

摘要

在本研究中,通过Illumina平台测序技术获得了首个完整的叶绿体基因组。基因组大小为158,943个碱基对,由一对长度为26,043 bp的反向重复序列(IR)、一个88,167 bp的大单拷贝(LSC)区域和一个18,690 bp的小单拷贝(SSC)区域组成。该基因组有112个独特基因,其中包括79个蛋白质编码基因、29个tRNA和4个rRNA。系统发育分析表明,[物种名称]在杨梅科内与[另一物种名称]聚类在一起。 (注:原文中部分物种名称缺失,翻译时用[物种名称]表示)

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/eef0/7819111/9eb756ea2ef4/TMDN_A_1845997_F0001_B.jpg

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