• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

Author Correction: Error correction enables use of Oxford Nanopore technology for reference-free transcriptome analysis.

作者信息

Sahlin Kristoffer, Medvedev Paul

机构信息

Department of Mathematics, Science for Life Laboratory, Stockholm University, 106 91, Stockholm, Sweden.

Department of Computer Science and Engineering, The Pennsylvania State University, University Park, PA, USA.

出版信息

Nat Commun. 2021 Feb 8;12(1):992. doi: 10.1038/s41467-021-21424-9.

DOI:10.1038/s41467-021-21424-9
PMID:33558522
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7870856/
Abstract
摘要

相似文献

1
Author Correction: Error correction enables use of Oxford Nanopore technology for reference-free transcriptome analysis.作者更正:纠错使牛津纳米孔技术能够用于无参考转录组分析。
Nat Commun. 2021 Feb 8;12(1):992. doi: 10.1038/s41467-021-21424-9.
2
Oxford Nanopore sequencing, hybrid error correction, and de novo assembly of a eukaryotic genome.牛津纳米孔测序、混合纠错及真核生物基因组的从头组装
Genome Res. 2015 Nov;25(11):1750-6. doi: 10.1101/gr.191395.115. Epub 2015 Oct 7.
3
Transcriptome profiling analysis of tea plant (Camellia sinensis) using Oxford Nanopore long-read RNA-Seq technology.利用牛津纳米孔长读 RNA-Seq 技术对茶树(Camellia sinensis)进行转录组谱分析。
Gene. 2021 Feb 15;769:145247. doi: 10.1016/j.gene.2020.145247. Epub 2020 Oct 20.
4
Characterization, correction and de novo assembly of an Oxford Nanopore genomic dataset from Agrobacterium tumefaciens.根癌土壤杆菌牛津纳米孔基因组数据集的表征、校正和从头组装
Sci Rep. 2016 Jun 28;6:28625. doi: 10.1038/srep28625.
5
Rapid High-Resolution Typing of Class I HLA Genes by Nanopore Sequencing.利用纳米孔测序技术快速高分辨率分型 I 类 HLA 基因。
Methods Mol Biol. 2020;2120:93-99. doi: 10.1007/978-1-0716-0327-7_6.
6
Genome assembly using Nanopore-guided long and error-free DNA reads.使用纳米孔引导的长且无错误的DNA reads进行基因组组装。
BMC Genomics. 2015 Apr 20;16(1):327. doi: 10.1186/s12864-015-1519-z.
7
Comprehensive comparison of Pacific Biosciences and Oxford Nanopore Technologies and their applications to transcriptome analysis.太平洋生物科学公司和牛津纳米孔技术公司的全面比较及其在转录组分析中的应用。
F1000Res. 2017 Feb 3;6:100. doi: 10.12688/f1000research.10571.2. eCollection 2017.
8
TP53 gene mutation analysis in chronic lymphocytic leukemia by nanopore MinION sequencing.通过纳米孔MinION测序对慢性淋巴细胞白血病进行TP53基因突变分析
Diagn Pathol. 2016 Oct 10;11(1):96. doi: 10.1186/s13000-016-0550-y.
9
De novo Nanopore read quality improvement using deep learning.基于深度学习的从头纳米孔读质量改进。
BMC Bioinformatics. 2019 Nov 6;20(1):552. doi: 10.1186/s12859-019-3103-z.
10
NanoReviser: An Error-Correction Tool for Nanopore Sequencing Based on a Deep Learning Algorithm.NanoReviser:一种基于深度学习算法的纳米孔测序纠错工具。
Front Genet. 2020 Aug 12;11:900. doi: 10.3389/fgene.2020.00900. eCollection 2020.

引用本文的文献

1
Finding the right fit: evaluation of short-read and long-read sequencing approaches to maximize the utility of clinical microbiome data.找到合适的方法:评估短读长读测序方法,以最大限度地提高临床微生物组数据的效用。
Microb Genom. 2022 Mar;8(3). doi: 10.1099/mgen.0.000794.
2
Sequencing of individual barcoded cDNAs using Pacific Biosciences and Oxford Nanopore Technologies reveals platform-specific error patterns.使用 Pacific Biosciences 和 Oxford Nanopore Technologies 对个体条形码 cDNA 进行测序可揭示特定于平台的错误模式。
Genome Res. 2022 Apr;32(4):726-737. doi: 10.1101/gr.276405.121. Epub 2022 Mar 17.
3
Methods for the targeted sequencing and analysis of integrons and their gene cassettes from complex microbial communities.针对复杂微生物群落中的整合子及其基因盒进行靶向测序和分析的方法。
Microb Genom. 2022 Mar;8(3). doi: 10.1099/mgen.0.000788.
4
rRNA Analysis Based on Long-Read High-Throughput Sequencing Reveals a More Accurate Diagnostic for the Bacterial Infection of Ascites.基于长读长高通量测序的 rRNA 分析可更准确地诊断腹水细菌感染。
Biomed Res Int. 2021 Nov 17;2021:6287280. doi: 10.1155/2021/6287280. eCollection 2021.