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生物制药污染物——污染赫氏菌菌株CCM 7991的基因组序列草图

Draft Genome Sequence of Herminiimonas contaminans Strain CCM 7991, a Biopharmaceutical Contaminant.

作者信息

Kangale Luis Johnson, Zgheib Rita, Ghigo Eric, Raoult Didier, Fournier Pierre-Edouard

机构信息

Aix-Marseille University, IRD, AP-HM, SSA, VITROME, Marseille, France.

IHU Méditerranée Infection, Marseille, France.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2021 Feb 18;10(7):e01432-20. doi: 10.1128/MRA.01432-20.

DOI:10.1128/MRA.01432-20
PMID:33602736
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7892669/
Abstract

was described as a new bacterial species, a contaminant isolated from a biopharmaceutical production process in Sweden. Since the genome sequence was not available, we performed draft genome sequencing. The genome of strain CCM 7991 (=CCUG 53591 = DSM 28178 = Marseille-Q4544) was 4,038,814 bp long, with a G+C content of 53.9%; a total of 3,860 genes were identified, along with 3 rRNAs, 44 tRNAs, and 4 noncoding RNAs (ncRNAs).

摘要

被描述为一种新的细菌物种,是从瑞典生物制药生产过程中分离出的一种污染物。由于无法获得基因组序列,我们进行了基因组草图测序。菌株CCM 7991(=CCUG 53591 = DSM 28178 = Marseille-Q4544)的基因组长度为4,038,814 bp,G+C含量为53.9%;共鉴定出3,860个基因,以及3个rRNA、44个tRNA和4个非编码RNA(ncRNA)。

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