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来自日本的1997年清水氏(襀翅目:叉襀科)的完整线粒体基因组。

The complete mitochondrial genome of Shimizu, 1997 (Plecoptera: Nemouridae) from Japan.

作者信息

Wang Ying, Cao Jinjun, Murányi Dávid, Chen Xiling, Yan Fenming

机构信息

College of Plant Protection, Henan Agricultural University, Zhengzhou, China.

Postdoctoral Research Base, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 15;6(3):846-847. doi: 10.1080/23802359.2021.1884029.

Abstract

The genus belongs to the family Nemouridae (Plecoptera) and has 205 species in the Holarctic and Oriental Regions. We sequenced the fourth complete mitochondrial genome of Shimizu, 1997. The mitogenome is 15,827 bp long with 37 genes plus a control region with an A + T content of 68.9%. There are 10 intergenic spacers (75 bp total) and 13 gene overlaps (43 bp total). All protein-coding genes (PCGs) use normal initiation codons, except and which begin with TTG and GTG. Two PCGs ( and ) use a single T as a partial termination codon. Phylogenetic analyses showed that and were sister group resulting in a paraphyletic Amphinemurinae different from the morphological classification.

摘要

该属隶属于叉襀科(襀翅目),在全北区和东洋区有205个物种。我们对1997年清水氏叉襀的第四个完整线粒体基因组进行了测序。该线粒体基因组长度为15,827 bp,有37个基因以及一个控制区,A+T含量为68.9%。有10个基因间隔区(共75 bp)和13个基因重叠区(共43 bp)。除了以TTG和GTG起始的cox1和nad1外,所有蛋白质编码基因(PCGs)都使用正常的起始密码子。两个PCGs(cox1和nad4)使用单个T作为部分终止密码子。系统发育分析表明,清水氏叉襀和周氏叉襀是姐妹群,导致叉襀亚科成为并系群,这与形态学分类不同。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/11f0/7971268/113caf79eed9/TMDN_A_1884029_F0001_B.jpg

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