• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

美国早期引入和传播的 SARS-CoV-2 变异株 B.1.1.7。

Early introductions and transmission of SARS-CoV-2 variant B.1.1.7 in the United States.

机构信息

Department of Epidemiology of Microbial Diseases, Yale School of Public Health, New Haven, CT 06510, USA.

Wadsworth Center, New York State Department of Health, Albany, NY 12208, USA; Department of Biomedical Sciences, University at Albany, SUNY, Albany, NY 12222, USA.

出版信息

Cell. 2021 May 13;184(10):2595-2604.e13. doi: 10.1016/j.cell.2021.03.061. Epub 2021 Apr 3.

DOI:10.1016/j.cell.2021.03.061
PMID:
33891875
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8018830/
Abstract

The emergence and spread of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7, first detected in the United Kingdom, has become a global public health concern because of its increased transmissibility. Over 2,500 COVID-19 cases associated with this variant have been detected in the United States (US) since December 2020, but the extent of establishment is relatively unknown. Using travel, genomic, and diagnostic data, we highlight that the primary ports of entry for B.1.1.7 in the US were in New York, California, and Florida. Furthermore, we found evidence for many independent B.1.1.7 establishments starting in early December 2020, followed by interstate spread by the end of the month. Finally, we project that B.1.1.7 will be the dominant lineage in many states by mid- to late March. Thus, genomic surveillance for B.1.1.7 and other variants urgently needs to be enhanced to better inform the public health response.

摘要

SARS-CoV-2 谱系 B.1.1.7 的出现和传播引起了全球公共卫生关注,因为它具有更高的传染性。自 2020 年 12 月以来,美国已检测到与该变体相关的 2500 多例 COVID-19 病例,但该变体的建立程度尚不清楚。利用旅行、基因组和诊断数据,我们强调 B.1.1.7 在美国的主要入境口岸是纽约、加利福尼亚和佛罗里达。此外,我们发现有证据表明,从 2020 年 12 月初开始,就有许多独立的 B.1.1.7 建立,到月底就已经在州际传播。最后,我们预计到 3 月中旬至下旬,B.1.1.7 将成为许多州的主要谱系。因此,迫切需要加强对 B.1.1.7 和其他变体的基因组监测,以便更好地为公共卫生应对措施提供信息。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/b121d8fc6ddf/figs5_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/67fee63241f8/fx1_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/fe41676ce9b1/gr1_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/4a61245e8691/gr2_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/48c49ba81ea2/figs1_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/7f76fe73123a/gr3_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/ceb604a047e3/figs2_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/018223a00275/gr4_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/0944a8b62e26/figs3_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/9f4ce59434a0/figs4_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/b121d8fc6ddf/figs5_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/67fee63241f8/fx1_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/fe41676ce9b1/gr1_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/4a61245e8691/gr2_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/48c49ba81ea2/figs1_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/7f76fe73123a/gr3_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/ceb604a047e3/figs2_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/018223a00275/gr4_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/0944a8b62e26/figs3_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/9f4ce59434a0/figs4_lrg.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d672/8018830/b121d8fc6ddf/figs5_lrg.jpg

相似文献

1
Early introductions and transmission of SARS-CoV-2 variant B.1.1.7 in the United States.美国早期引入和传播的 SARS-CoV-2 变异株 B.1.1.7。
Cell. 2021 May 13;184(10):2595-2604.e13. doi: 10.1016/j.cell.2021.03.061. Epub 2021 Apr 3.
2
Early introductions and community transmission of SARS-CoV-2 variant B.1.1.7 in the United States.严重急性呼吸综合征冠状病毒2变异株B.1.1.7在美国的早期引入及社区传播
medRxiv. 2021 Mar 11:2021.02.10.21251540. doi: 10.1101/2021.02.10.21251540.
3
Emergence and rapid transmission of SARS-CoV-2 B.1.1.7 in the United States.美国出现并迅速传播 SARS-CoV-2 变异株 B.1.1.7。
Cell. 2021 May 13;184(10):2587-2594.e7. doi: 10.1016/j.cell.2021.03.052. Epub 2021 Mar 30.
4
Emergence of SARS-CoV-2 B.1.1.7 Lineage - United States, December 29, 2020-January 12, 2021.SARS-CoV-2 B.1.1.7 谱系的出现 - 美国,2020 年 12 月 29 日-2021 年 1 月 12 日。
MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2021 Jan 22;70(3):95-99. doi: 10.15585/mmwr.mm7003e2.
5
Baseline Sequencing Surveillance of Public Clinical Testing, Hospitals, and Community Wastewater Reveals Rapid Emergence of SARS-CoV-2 Omicron Variant of Concern in Arizona, USA.美国亚利桑那州公共临床检测、医院和社区污水的基线测序监测显示,SARS-CoV-2 关注的奥密克戎变异株迅速出现。
mBio. 2023 Feb 28;14(1):e0310122. doi: 10.1128/mbio.03101-22. Epub 2023 Jan 9.
6
Early Emergence Phase of SARS-CoV-2 Delta Variant in Florida, US.美国佛罗里达州 SARS-CoV-2 德尔塔变异株的早期出现阶段。
Viruses. 2022 Apr 6;14(4):766. doi: 10.3390/v14040766.
7
Investigating the possible origin and transmission routes of SARS-CoV-2 genomes and variants of concern in Bangladesh.调查 SARS-CoV-2 基因组及其在孟加拉国关注变体的可能起源和传播途径。
Infect Genet Evol. 2021 Nov;95:105057. doi: 10.1016/j.meegid.2021.105057. Epub 2021 Sep 1.
8
SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) Variant - United States, December 1-8, 2021.SARS-CoV-2 B.1.1.529(奥密克戎)变异株-美国,2021 年 12 月 1 日-8 日。
MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2021 Dec 17;70(50):1731-1734. doi: 10.15585/mmwr.mm7050e1.
9
The dynamic change of SARS-CoV-2 variants in Sierra Leone.塞拉利昂出现的 SARS-CoV-2 变异株的动态变化。
Infect Genet Evol. 2022 Mar;98:105208. doi: 10.1016/j.meegid.2022.105208. Epub 2022 Jan 6.
10
The Alpha Variant (B.1.1.7) of SARS-CoV-2 Failed to Become Dominant in Mexico.阿尔法变异株(B.1.1.7)未能在墨西哥成为优势株。
Microbiol Spectr. 2022 Apr 27;10(2):e0224021. doi: 10.1128/spectrum.02240-21. Epub 2022 Apr 7.

引用本文的文献

1
Analysis of the prevalence, spread, and mutation patterns of SARS-CoV-2 variants: data from COVID-19 testing expansion strategy study in salvador, Northeast Brazil.严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)变体的流行率、传播及突变模式分析:来自巴西东北部萨尔瓦多市新冠病毒检测扩展策略研究的数据
Sci Rep. 2025 Aug 29;15(1):31866. doi: 10.1038/s41598-025-17691-x.
2
Tracing SARS-CoV-2 clusters across local scales using genomic data.利用基因组数据追踪局部范围内的新冠病毒集群。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2025 Aug 12;122(32):e2501435122. doi: 10.1073/pnas.2501435122. Epub 2025 Aug 7.
3
Phylogenetic insights into the early spread of the SARS-CoV-2 Alpha variant across Europe.

本文引用的文献

1
Emergence and rapid transmission of SARS-CoV-2 B.1.1.7 in the United States.美国出现并迅速传播 SARS-CoV-2 变异株 B.1.1.7。
Cell. 2021 May 13;184(10):2587-2594.e7. doi: 10.1016/j.cell.2021.03.052. Epub 2021 Mar 30.
2
Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil.巴西玛瑙斯市 P.1 型 SARS-CoV-2 谱系的基因组学和流行病学研究。
Science. 2021 May 21;372(6544):815-821. doi: 10.1126/science.abh2644. Epub 2021 Apr 14.
3
Tracking SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 dissemination: insights from nationwide spike gene target failure (SGTF) and spike gene late detection (SGTL) data, Portugal, week 49 2020 to week 3 2021.
对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)阿尔法变异株在欧洲早期传播的系统发育学见解。
Virus Evol. 2025 Jun 25;11(1):veaf030. doi: 10.1093/ve/veaf030. eCollection 2025.
4
Large-Scale Genomic Analysis of SARS-CoV-2 Omicron BA.5 Emergence, United States.美国新冠病毒奥密克戎BA.5毒株出现的大规模基因组分析
Emerg Infect Dis. 2025 May;31(13):45-56. doi: 10.3201/eid3113.240981.
5
Characterizing spatial epidemiology in a heterogeneous transmission landscape using the spatial transmission count statistic.使用空间传播计数统计量来描述异质传播环境中的空间流行病学。
Commun Med (Lond). 2025 May 9;5(1):165. doi: 10.1038/s43856-025-00888-6.
6
Virus Detection by CRISPR-Cas9-Mediated Strand Displacement in a Lateral Flow Assay.在侧流分析中通过CRISPR-Cas9介导的链置换进行病毒检测
ACS Appl Bio Mater. 2025 May 19;8(5):4221-4229. doi: 10.1021/acsabm.5c00307. Epub 2025 Apr 24.
7
Leveraging mobility data to analyze persistent SARS-CoV-2 mutations and inform targeted genomic surveillance.利用流动性数据分析新冠病毒持续存在的突变并为靶向基因组监测提供信息。
Elife. 2025 Jan 15;13:RP94045. doi: 10.7554/eLife.94045.
8
Effectiveness of mRNA COVID-19 Vaccines and Hybrid Immunity in Preventing SARS-CoV-2 Infection and Symptomatic COVID-19 Among Adults in the United States.美国成年人中mRNA新冠疫苗及混合免疫在预防SARS-CoV-2感染和有症状的新冠病毒病方面的有效性
J Infect Dis. 2025 Apr 15;231(4):e743-e753. doi: 10.1093/infdis/jiaf007.
9
From Emergence to Evolution: Dynamics of the SARS-CoV-2 Omicron Variant in Florida.从出现到进化:佛罗里达州新冠病毒奥密克戎变种的动态变化
Pathogens. 2024 Dec 12;13(12):1095. doi: 10.3390/pathogens13121095.
10
SARS-CoV-2 Illumina GeNome Assembly Line (SIGNAL), a Snakemate workflow for rapid and bulk analysis of Illumina sequencing of SARS-CoV-2 genomes.严重急性呼吸综合征冠状病毒2型Illumina基因组装配线(SIGNAL),一种用于快速批量分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2型基因组Illumina测序的Snakemate工作流程。
NAR Genom Bioinform. 2024 Dec 18;6(4):lqae176. doi: 10.1093/nargab/lqae176. eCollection 2024 Dec.
追踪 SARS-CoV-2 谱系 B.1.1.7 的传播:来自全国范围内刺突基因目标失败(SGTF)和刺突基因晚期检测(SGTL)数据的见解,葡萄牙,2020 年第 49 周至 2021 年第 3 周。
Euro Surveill. 2021 Mar;26(10). doi: 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.10.2100130.
4
Estimated transmissibility and impact of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in England.在英格兰,估计 SARS-CoV-2 谱系 B.1.1.7 的传染性和影响。
Science. 2021 Apr 9;372(6538). doi: 10.1126/science.abg3055. Epub 2021 Mar 3.
5
Public health actions to control new SARS-CoV-2 variants.公共卫生措施以控制新型 SARS-CoV-2 变异株。
Cell. 2021 Mar 4;184(5):1127-1132. doi: 10.1016/j.cell.2021.01.044. Epub 2021 Jan 29.
6
Covid-19: The E484K mutation and the risks it poses.新冠病毒:E484K突变及其带来的风险。
BMJ. 2021 Feb 5;372:n359. doi: 10.1136/bmj.n359.
7
SARS-CoV-2 evolution during treatment of chronic infection.慢性感染治疗过程中 SARS-CoV-2 的进化。
Nature. 2021 Apr;592(7853):277-282. doi: 10.1038/s41586-021-03291-y. Epub 2021 Feb 5.
8
Modelling airport catchment areas to anticipate the spread of infectious diseases across land and air travel.建立机场服务区模型以预测陆地和航空旅行中传染病的传播。
Spat Spatiotemporal Epidemiol. 2021 Feb;36:100380. doi: 10.1016/j.sste.2020.100380. Epub 2020 Oct 27.
9
Emergence of SARS-CoV-2 B.1.1.7 Lineage - United States, December 29, 2020-January 12, 2021.SARS-CoV-2 B.1.1.7 谱系的出现 - 美国,2020 年 12 月 29 日-2021 年 1 月 12 日。
MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2021 Jan 22;70(3):95-99. doi: 10.15585/mmwr.mm7003e2.
10
Genetic Variants of SARS-CoV-2-What Do They Mean?新型冠状病毒2019(SARS-CoV-2)的基因变异——它们意味着什么?
JAMA. 2021 Feb 9;325(6):529-531. doi: 10.1001/jama.2020.27124.