• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

基因组监测活动揭示了在巴西出现的引起关注的 SARS-CoV-2 B.1.525 变异株:病例报告。

Genomic surveillance activities unveil the introduction of the SARS-CoV-2 B.1.525 variant of interest in Brazil: Case report.

机构信息

Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia - LACEN-BA, Salvador, Brazil.

Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil.

出版信息

J Med Virol. 2021 Sep;93(9):5523-5526. doi: 10.1002/jmv.27086. Epub 2021 May 25.

DOI:10.1002/jmv.27086
PMID:33990970
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8242367/
Abstract

The appearance of new variants of SARS-CoV-2 has recently challenged public health authorities with respect to tracking transmission and mitigating the impact in the evolving pandemic across countries. B.1.525 is considered a variant under investigation since it carries specific genetic signatures present in P.1, B.1.1.7, and B.1.351. Here we report genomic evidence of the first likely imported case of the SARS-CoV-2 B.1.525 variant, isolated in a traveler returning from Nigeria.

摘要

最近,SARS-CoV-2 的新变体的出现给各国的公共卫生部门带来了挑战,需要追踪其传播并减轻其在不断演变的大流行中的影响。B.1.525 被认为是一种正在调查的变体,因为它携带 P.1、B.1.1.7 和 B.1.351 中存在的特定遗传特征。在这里,我们报告了首例可能从尼日利亚返回的旅行者中分离出的 SARS-CoV-2 B.1.525 变体的基因组证据。

相似文献

1
Genomic surveillance activities unveil the introduction of the SARS-CoV-2 B.1.525 variant of interest in Brazil: Case report.基因组监测活动揭示了在巴西出现的引起关注的 SARS-CoV-2 B.1.525 变异株:病例报告。
J Med Virol. 2021 Sep;93(9):5523-5526. doi: 10.1002/jmv.27086. Epub 2021 May 25.
2
Imported SARS-CoV-2 Variant P.1 in Traveler Returning from Brazil to Italy.从巴西返回意大利的旅行者中发现的新冠病毒变异毒株P.1
Emerg Infect Dis. 2021 Apr;27(4):1249-1251. doi: 10.3201/eid2704.210183. Epub 2021 Feb 10.
3
Importation of SARS-CoV-2 Variant B.1.1.7 in Pakistan.新冠病毒变异株B.1.1.7输入巴基斯坦。
J Med Virol. 2021 May;93(5):2623-2625. doi: 10.1002/jmv.26869. Epub 2021 Feb 19.
4
New SARS-CoV-2 variant of concern imported from the United Kingdom to Vietnam, December 2020.2020年12月,从英国传入越南的新型严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)变异株。
J Med Virol. 2021 May;93(5):2628-2630. doi: 10.1002/jmv.26908. Epub 2021 Mar 9.
5
Novel SARS-CoV-2 Variant in Travelers from Brazil to Japan.从巴西到日本旅行者中的新型 SARS-CoV-2 变异株。
Emerg Infect Dis. 2021 Apr;27(4):1243-5. doi: 10.3201/eid2704.210138. Epub 2021 Feb 10.
6
SARS-CoV-2 AY.4.2 variant circulating in Italy: Genomic preliminary insight.意大利流行的 SARS-CoV-2 AY.4.2 变异株:基因组初步观察结果。
J Med Virol. 2022 Apr;94(4):1689-1692. doi: 10.1002/jmv.27451. Epub 2021 Nov 17.
7
Short Report: Early genomic detection of SARS-CoV-2 P.1 variant in Northeast Brazil.短篇报告:巴西东北部对 SARS-CoV-2 P.1 变异株的早期基因组检测。
PLoS Negl Trop Dis. 2021 Jul 19;15(7):e0009591. doi: 10.1371/journal.pntd.0009591. eCollection 2021 Jul.
8
Imported SARS-CoV-2 V501Y.V2 variant (B.1.351) detected in travelers from South Africa and Tanzania to India.在从南非和坦桑尼亚前往印度的旅行者中检测到输入性严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)V501Y.V2变体(B.1.351)。
Travel Med Infect Dis. 2021 May-Jun;41:102023. doi: 10.1016/j.tmaid.2021.102023. Epub 2021 Mar 14.
9
Genomic assessment of quarantine measures to prevent SARS-CoV-2 importation and transmission.基因组评估检疫措施以防止 SARS-CoV-2 的输入和传播。
Nat Commun. 2022 Feb 23;13(1):1012. doi: 10.1038/s41467-022-28371-z.
10
Genomic surveillance of SARS-CoV-2 tracks early interstate transmission of P.1 lineage and diversification within P.2 clade in Brazil.对 SARS-CoV-2 的基因组监测追踪了 P.1 谱系在巴西的州际早期传播以及 P.2 分支内的多样化。
PLoS Negl Trop Dis. 2021 Oct 13;15(10):e0009835. doi: 10.1371/journal.pntd.0009835. eCollection 2021 Oct.

引用本文的文献

1
Advancements in Structural Basis of Covalent Inhibitors Targeting SARS-CoV-2 Essential Proteins.靶向严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)关键蛋白的共价抑制剂的结构基础研究进展
Curr Med Chem. 2025;32(19):3790-3824. doi: 10.2174/0109298673323348241208080419.
2
SARS-CoV-2 journey: from alpha variant to omicron and its sub-variants.SARS-CoV-2 之旅:从阿尔法变异株到奥密克戎及其亚变异株。
Infection. 2024 Jun;52(3):767-786. doi: 10.1007/s15010-024-02223-y. Epub 2024 Mar 30.
3
Technology transfer during the COVID-19 pandemic: report on the first face-to-face practical training course in Brazil.COVID-19 大流行期间的技术转让:巴西首次面对面实践培训课程报告。
Epidemiol Serv Saude. 2023 Aug 18;32(2):e2022614. doi: 10.1590/S2237-96222023000200017. eCollection 2023.
4
An RBD bispecific antibody effectively neutralizes a SARS-CoV-2 Omicron variant.一种RBD双特异性抗体可有效中和新冠病毒奥密克戎变种。
One Health Adv. 2023;1(1):12. doi: 10.1186/s44280-023-00012-0. Epub 2023 Apr 30.
5
A SARS-CoV-2: Companion Animal Transmission and Variants Classification.严重急性呼吸综合征冠状病毒2:伴侣动物传播与变异分类
Pathogens. 2023 May 29;12(6):775. doi: 10.3390/pathogens12060775.
6
Emergence and spread of two SARS-CoV-2 variants of interest in Nigeria.尼日利亚出现两种引起关注的 SARS-CoV-2 变异株。
Nat Commun. 2023 Feb 13;14(1):811. doi: 10.1038/s41467-023-36449-5.
7
SARS-CoV-2 Genomic Surveillance in Brazil: A Systematic Review with Scientometric Analysis.巴西的 SARS-CoV-2 基因组监测:系统评价与科学计量分析。
Viruses. 2022 Dec 5;14(12):2715. doi: 10.3390/v14122715.
8
Towards an optimal monoclonal antibody with higher binding affinity to the receptor-binding domain of SARS-CoV-2 spike proteins from different variants.旨在获得与不同变体的 SARS-CoV-2 刺突蛋白受体结合域具有更高结合亲和力的最优单克隆抗体。
Colloids Surf B Biointerfaces. 2023 Jan;221:112986. doi: 10.1016/j.colsurfb.2022.112986. Epub 2022 Oct 29.
9
SARS-COV-2/COVID-19: scenario, epidemiology, adaptive mutations, and environmental factors.严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 型/COVID-19:情景、流行病学、适应性突变和环境因素。
Environ Sci Pollut Res Int. 2022 Oct;29(46):69117-69136. doi: 10.1007/s11356-022-22333-0. Epub 2022 Aug 10.
10
Advancements in Testing Strategies for COVID-19.COVID-19 检测策略的进展。
Biosensors (Basel). 2022 Jun 13;12(6):410. doi: 10.3390/bios12060410.

本文引用的文献

1
E484K mutation in SARS-CoV-2 RBD enhances binding affinity with hACE2 but reduces interactions with neutralizing antibodies and nanobodies: Binding free energy calculation studies.SARS-CoV-2 RBD 中的 E484K 突变增强了与 hACE2 的结合亲和力,但降低了与中和抗体和纳米抗体的相互作用:结合自由能计算研究。
J Mol Graph Model. 2021 Dec;109:108035. doi: 10.1016/j.jmgm.2021.108035. Epub 2021 Sep 17.
2
Assignment of epidemiological lineages in an emerging pandemic using the pangolin tool.使用穿山甲工具对新出现的大流行中的流行病学谱系进行分类。
Virus Evol. 2021 Jul 30;7(2):veab064. doi: 10.1093/ve/veab064. eCollection 2021.
3
Data, disease and diplomacy: GISAID's innovative contribution to global health.数据、疾病与外交:全球共享流感数据倡议组织对全球健康的创新贡献。
Glob Chall. 2017 Jan 10;1(1):33-46. doi: 10.1002/gch2.1018. eCollection 2017 Jan.
4
Genome Detective: an automated system for virus identification from high-throughput sequencing data.基因组侦探:一种从高通量测序数据中自动识别病毒的系统。
Bioinformatics. 2019 Mar 1;35(5):871-873. doi: 10.1093/bioinformatics/bty695.
5
Parallelization of MAFFT for large-scale multiple sequence alignments.并行化 MAFFT 进行大规模多序列比对。
Bioinformatics. 2018 Jul 15;34(14):2490-2492. doi: 10.1093/bioinformatics/bty121.
6
TreeTime: Maximum-likelihood phylodynamic analysis.TreeTime:最大似然系统发育动力学分析。
Virus Evol. 2018 Jan 8;4(1):vex042. doi: 10.1093/ve/vex042. eCollection 2018 Jan.
7
IQ-TREE: a fast and effective stochastic algorithm for estimating maximum-likelihood phylogenies.IQ-TREE:一种用于估计最大似然系统发育树的快速且有效的随机算法。
Mol Biol Evol. 2015 Jan;32(1):268-74. doi: 10.1093/molbev/msu300. Epub 2014 Nov 3.