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……的完整叶绿体基因组

The complete chloroplast genome of .

作者信息

Liu Yun-Ke, Liu Wei, Xiao Qian-Gang, Zeng Zhen, Zhuang Li, Zhang Ting-Hao, Zhang Jun, Huang Qian-Ying, Wang Bao-Xin

机构信息

Chengdu Academy of Agricultural and Forestry Sciences, Chengdu, Sichuan, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jun 3;6(7):1824-1825. doi: 10.1080/23802359.2021.1930599.

DOI:10.1080/23802359.2021.1930599
PMID:34124356
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8183503/
Abstract

is of the unique edible bamboo specie of high quality in China. We studied the complete chloroplast(cp) genome of in this study. The cp genome of (GenBank accession: MW186792) was 138,911 bp in length, including a large single-copy (LSC) region of 82,498 bp, a small single-copy (SSC) region of 12,743 bp and a pair of inverted repeated (IR) regions of 21,835 bp. The genome contained 133 genes, including 86 protein-coding genes, 39 tRNA genes, and 8 rRNA genes. Based on 39 cp genomes, we used the phylogenetic analysis to build phylogenetic tree, indicating that is closely related to . Also, the phylogenetic relationship of lineages might be (Hsuehochloa + (((Shibataea clade + Arundinaria clade) + Indocalamus wilsonii) + ((Bergbambos + Indocalamus) + (((African alpine bamboos + Gaoligongshania) + (Chimonocalamus + Kuruna))+(Thamnocalamus + Phyllostachys clade))))). It could be devoted to phylogenetic analysis of Arundinarieae.

摘要

是中国特有的优质食用竹种。在本研究中,我们对其完整叶绿体(cp)基因组进行了研究。(GenBank登录号:MW186792)的cp基因组长度为138,911 bp,包括一个82,498 bp的大单拷贝(LSC)区域、一个12,743 bp的小单拷贝(SSC)区域和一对21,835 bp的反向重复(IR)区域。该基因组包含133个基因,包括86个蛋白质编码基因、39个tRNA基因和8个rRNA基因。基于39个cp基因组,我们进行系统发育分析构建系统发育树,表明与密切相关。此外,各谱系的系统发育关系可能是(玉山竹属+(((刚竹亚科分支+青篱竹亚科分支)+鄂西箬竹)+((伯格竹属+箬竹属)+((非洲高山竹类+高黎贡山竹属)+(寒竹属+库鲁纳竹属))+(筱竹属+刚竹属分支))))。它可用于青篱竹族的系统发育分析。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/dc70/8183503/1c32a3776ac5/TMDN_A_1930599_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/dc70/8183503/1c32a3776ac5/TMDN_A_1930599_F0001_B.jpg
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