• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

合成并递呈稳定磷酸化泛素探针以研究线粒体自噬中的泛素化连接

Synthesis and delivery of a stable phosphorylated ubiquitin probe to study ubiquitin conjugation in mitophagy.

机构信息

Schulich Faculty of Chemistry, Technion-Israel Institute of Technology Haifa, 3200008, Israel.

Faculty of Biology, Technion-Israel Institute of Technology Haifa, 3200008, Israel.

出版信息

Chem Commun (Camb). 2021 Sep 16;57(74):9438-9441. doi: 10.1039/d1cc04045f.

DOI:10.1039/d1cc04045f
PMID:34528945
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8445162/
Abstract

Protein post-translational modifications are involved in essentially all aspects of cellular signaling. Their dynamic nature and the difficulties in installing them using enzymatic approaches limits their direct study in human cells. Reported herein is the first synthesis, delivery and cellular study of a stable phosphoubiquitin probe. Our results compare Parkin's substrate preference during mitophagy direct visualization of a phosphorylated ubiquitin probe in the cellular environment.

摘要

蛋白质翻译后修饰参与细胞信号转导的各个方面。由于其动态性质以及使用酶法进行修饰的困难,限制了对其在人细胞中的直接研究。本文首次报道了一种稳定的磷酸泛素探针的合成、递送和细胞研究。我们的结果比较了 Parkin 在有丝分裂自噬过程中的底物偏好,直接观察到细胞环境中磷酸化泛素探针的存在。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7ca3/8445162/f511c735f889/d1cc04045f-f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7ca3/8445162/18c0be41bc13/d1cc04045f-s1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7ca3/8445162/d99708dd7b78/d1cc04045f-f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7ca3/8445162/f511c735f889/d1cc04045f-f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7ca3/8445162/18c0be41bc13/d1cc04045f-s1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7ca3/8445162/d99708dd7b78/d1cc04045f-f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7ca3/8445162/f511c735f889/d1cc04045f-f2.jpg

相似文献

1
Synthesis and delivery of a stable phosphorylated ubiquitin probe to study ubiquitin conjugation in mitophagy.合成并递呈稳定磷酸化泛素探针以研究线粒体自噬中的泛素化连接
Chem Commun (Camb). 2021 Sep 16;57(74):9438-9441. doi: 10.1039/d1cc04045f.
2
How Chemical Synthesis of Ubiquitin Conjugates Helps To Understand Ubiquitin Signal Transduction.泛素缀合物的化学合成如何助力理解泛素信号转导
Bioconjug Chem. 2017 Mar 15;28(3):805-815. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.6b00140. Epub 2016 Apr 28.
3
Deubiquitinating enzyme specificity for ubiquitin chain topology profiled by di-ubiquitin activity probes.通过双泛素活性探针分析去泛素化酶对泛素链拓扑结构的特异性。
Chem Biol. 2013 Dec 19;20(12):1447-55. doi: 10.1016/j.chembiol.2013.10.012. Epub 2013 Nov 27.
4
Ubiquitin Linkage-Specific Affimers Reveal Insights into K6-Linked Ubiquitin Signaling.泛素连接特异性亲和分子揭示了对K6连接的泛素信号传导的见解。
Mol Cell. 2017 Oct 5;68(1):233-246.e5. doi: 10.1016/j.molcel.2017.08.020. Epub 2017 Sep 21.
5
Enhanced Delivery of Synthetic Labelled Ubiquitin into Live Cells by Using Next-Generation Ub-TAT Conjugates.利用下一代 Ub-TAT 缀合物将合成标记的泛素递送至活细胞中。
Chembiochem. 2018 Dec 18;19(24):2553-2557. doi: 10.1002/cbic.201800649. Epub 2018 Nov 27.
6
Ubiquitin C-terminal electrophiles are activity-based probes for identification and mechanistic study of ubiquitin conjugating machinery.泛素C末端亲电试剂是用于泛素共轭机制鉴定和机理研究的基于活性的探针。
ACS Chem Biol. 2009 Apr 17;4(4):275-87. doi: 10.1021/cb9000348.
7
A cascading activity-based probe sequentially targets E1-E2-E3 ubiquitin enzymes.一种基于活性的级联探针依次靶向E1-E2-E3泛素酶。
Nat Chem Biol. 2016 Jul;12(7):523-30. doi: 10.1038/nchembio.2084. Epub 2016 May 16.
8
Chemically ubiquitylated PCNA as a probe for eukaryotic translesion DNA synthesis.作为真核跨损伤 DNA 合成探针的化学泛素化 PCNA。
Nat Chem Biol. 2010 Apr;6(4):270-2. doi: 10.1038/nchembio.316. Epub 2010 Mar 7.
9
Development of activity-based probes for ubiquitin and ubiquitin-like protein signaling pathways.基于活性的泛素和泛素样蛋白信号通路探针的开发。
J Am Chem Soc. 2013 Nov 13;135(45):16948-62. doi: 10.1021/ja4099643. Epub 2013 Nov 1.
10
Synthesis of Isomeric Phosphoubiquitin Chains Reveals that Phosphorylation Controls Deubiquitinase Activity and Specificity.异构磷酸泛素链的合成表明磷酸化调控去泛素化酶的活性和特异性。
Cell Rep. 2016 Jul 26;16(4):1180-1193. doi: 10.1016/j.celrep.2016.06.064. Epub 2016 Jul 14.

引用本文的文献

1
Cytosolic Delivery of Functional Ubiquitin.功能性泛素的胞质递送
J Pept Sci. 2025 Jun;31(6):e70026. doi: 10.1002/psc.70026.
2
Genetic Code Expansion Approaches to Decipher the Ubiquitin Code.遗传密码扩展方法解析泛素密码。
Chem Rev. 2024 Oct 23;124(20):11544-11584. doi: 10.1021/acs.chemrev.4c00375. Epub 2024 Sep 23.
3
Synthesis of ubiquitinated proteins for biochemical and functional analysis.用于生化和功能分析的泛素化蛋白质的合成。

本文引用的文献

1
Deciphering protein post-translational modifications using chemical biology tools.使用化学生物学工具解析蛋白质翻译后修饰
Nat Rev Chem. 2020 Dec;4(12):674-695. doi: 10.1038/s41570-020-00223-8. Epub 2020 Oct 6.
2
Enhanced Live-Cell Delivery of Synthetic Proteins Assisted by Cell-Penetrating Peptides Fused to DABCYL.细胞穿透肽融合 DABCYL 增强的合成蛋白的活细胞传递。
Angew Chem Int Ed Engl. 2021 Mar 22;60(13):7333-7343. doi: 10.1002/anie.202016208. Epub 2021 Feb 22.
3
Ubiquitin Phosphorylation at Thr12 Modulates the DNA Damage Response.
Chem Sci. 2023 Aug 30;14(37):10025-10040. doi: 10.1039/d3sc03664b. eCollection 2023 Sep 27.
4
Structure-Uptake Relationship Study of DABCYL Derivatives Linked to Cyclic Cell-Penetrating Peptides for Live-Cell Delivery of Synthetic Proteins.DABCYL 衍生物与环状细胞穿透肽连接的结构摄取关系研究,用于合成蛋白的活细胞递送。
Angew Chem Int Ed Engl. 2022 Nov 21;61(47):e202207551. doi: 10.1002/anie.202207551. Epub 2022 Oct 19.
5
Antibody for Serine 65 Phosphorylated Ubiquitin Identifies PLK1-Mediated Phosphorylation of Mitotic Proteins and APC1.丝氨酸 65 磷酸化泛素抗体鉴定 PLK1 介导的有丝分裂蛋白和 APC1 的磷酸化。
Molecules. 2022 Jul 29;27(15):4867. doi: 10.3390/molecules27154867.
6
Probing the cell delivery of synthetic diubiquitin chains.探究合成二泛素链的细胞传递。
Chem Commun (Camb). 2022 Aug 4;58(63):8782-8785. doi: 10.1039/d2cc02476d.
7
Synthetic Proteins behind the Plasma Barrier: Molecular Spies.血浆屏障背后的合成蛋白:分子间谍。
Acc Chem Res. 2022 Aug 2;55(15):2055-2067. doi: 10.1021/acs.accounts.2c00236. Epub 2022 Jul 14.
8
Multiplexed Delivery of Synthetic (Un)Conjugatable Ubiquitin and SUMO2 Enables Simultaneous Monitoring of Their Localization and Function in Live Cells.多路复用合成(非)连接泛素和 SUMO2 的递送使活细胞中它们的定位和功能的同时监测成为可能。
Chembiochem. 2022 Jun 3;23(11):e202200122. doi: 10.1002/cbic.202200122. Epub 2022 Mar 11.
9
The chemical biology of ubiquitin.泛素的化学生物学。
Biochim Biophys Acta Gen Subj. 2022 Mar;1866(3):130079. doi: 10.1016/j.bbagen.2021.130079. Epub 2021 Dec 29.
泛素化 Thr12 磷酸化调节 DNA 损伤反应。
Mol Cell. 2020 Nov 5;80(3):423-436.e9. doi: 10.1016/j.molcel.2020.09.017. Epub 2020 Oct 5.
4
Global Landscape and Dynamics of Parkin and USP30-Dependent Ubiquitylomes in iNeurons during Mitophagic Signaling.在有丝分裂信号中 iNeurons 中 Parkin 和 USP30 依赖性泛素组的全球景观和动态。
Mol Cell. 2020 Mar 5;77(5):1124-1142.e10. doi: 10.1016/j.molcel.2019.11.013.
5
The Journey for the Total Chemical Synthesis of a 53 kDa Protein.53kDa 蛋白的全化学合成之旅。
Acc Chem Res. 2019 Dec 17;52(12):3361-3371. doi: 10.1021/acs.accounts.9b00372. Epub 2019 Sep 19.
6
How Phosphorylation by PINK1 Remodels the Ubiquitin System: A Perspective from Structure and Dynamics.由 PINK1 磷酸化重塑泛素系统:从结构和动力学角度看。
Biochemistry. 2020 Jan 14;59(1):26-33. doi: 10.1021/acs.biochem.9b00715. Epub 2019 Sep 23.
7
Palladium-Mediated Cleavage of Proteins with Thiazolidine-Modified Backbone in Live Cells.钯介导的活细胞中噻唑烷修饰骨架的蛋白质裂解。
Angew Chem Int Ed Engl. 2019 Sep 16;58(38):13540-13549. doi: 10.1002/anie.201906545. Epub 2019 Aug 23.
8
Targeted Subcellular Protein Delivery Using Cleavable Cyclic Cell-Penetrating Peptides.靶向细胞穿透肽的可切割环状细胞穿透肽的亚细胞蛋白递药。
Bioconjug Chem. 2019 Feb 20;30(2):400-404. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.8b00855. Epub 2019 Jan 14.
9
Enhanced Delivery of Synthetic Labelled Ubiquitin into Live Cells by Using Next-Generation Ub-TAT Conjugates.利用下一代 Ub-TAT 缀合物将合成标记的泛素递送至活细胞中。
Chembiochem. 2018 Dec 18;19(24):2553-2557. doi: 10.1002/cbic.201800649. Epub 2018 Nov 27.
10
Cell-Permeable Activity-Based Ubiquitin Probes Enable Intracellular Profiling of Human Deubiquitinases.细胞通透的基于活性的泛素探针可用于人类去泛素化酶的细胞内分析。
J Am Chem Soc. 2018 Oct 3;140(39):12424-12433. doi: 10.1021/jacs.8b05147. Epub 2018 Sep 21.