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GreeNC 2.0:一个植物长非编码 RNA 的综合数据库。

GreeNC 2.0: a comprehensive database of plant long non-coding RNAs.

机构信息

Dipartimento di Scienze Agrarie, Alimentari e Ambientali, Università degli Studi di Perugia, Borgo XX Giugno 74, 06121 Perugia, Italy.

Sequentia Biotech SL, Carrer de Pamplona 88, 08018, Barcelona, Spain.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7;50(D1):D1442-D1447. doi: 10.1093/nar/gkab1014.

DOI:10.1093/nar/gkab1014
PMID:34723326
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8728176/
Abstract

The Green Non-Coding Database (GreeNC) is one of the reference databases for the study of plant long non-coding RNAs (lncRNAs). Here we present our most recent update where 16 species have been updated, while 78 species have been added, resulting in the annotation of more than 495 000 lncRNAs. Moreover, sequence clustering was applied providing information about sequence conservation and gene families. The current version of the database is available at: http://greenc.sequentiabiotech.com/wiki2/Main_Page.

摘要

Green Non-Coding Database (GreeNC) 是研究植物长非编码 RNA (lncRNA) 的参考数据库之一。在此,我们展示了最新的更新内容,其中 16 个物种得到了更新,同时新增了 78 个物种,从而注释了超过 495000 个 lncRNA。此外,序列聚类也得到了应用,提供了序列保守性和基因家族的信息。该数据库的最新版本可在以下网址获取:http://greenc.sequentiabiotech.com/wiki2/Main_Page。

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