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范·奥夫韦根(2008年)(八放珊瑚亚纲:软珊瑚目)的完整线粒体基因组。

The complete mitochondrial genome of van Ofwegen, 2008 (Octocorallia: Alcyonacea).

作者信息

Yang Chaojie, Wu Zhongjie, Huang Yujing

机构信息

Key Laboratory of Utilization and Conservation for Tropical Marine Bioresources (Hainan Tropical Ocean University), Ministry of Education, Sanya, China.

Hainan Academy of Ocean and Fisheries Sciences, Haikou, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Jul 19;7(7):1299-1301. doi: 10.1080/23802359.2022.2095232. eCollection 2022.

Abstract

In this study, the complete mitochondrial genome (mitogenome) of van Ofwegen, 2008 was determined using next-generation sequencing (NGS) method. The mitogenome of is 18,743 bp in length, containing 14 protein-coding genes (PCGs), two ribosomal RNAs (rRNA) and one tRNA (tRNA-Met), which has same gene order with other species of ATG was determined as start codon in all 14 PCGs. Eight TAG, five TAA, and one incomplete codons (T-) were found as stop codon. Phylogenetic analysis of the small number of available mitogenomes showed that is closely related to and .

摘要

在本研究中,使用下一代测序(NGS)方法测定了2008年范·奥夫韦根的完整线粒体基因组(线粒体基因组)。其线粒体基因组长度为18743bp,包含14个蛋白质编码基因(PCGs)、两个核糖体RNA(rRNA)和一个转运RNA(tRNA-Met),其基因顺序与其他物种相同。在所有14个PCGs中,ATG被确定为起始密码子。发现8个TAG、5个TAA和1个不完整密码子(T-)作为终止密码子。对少数可用线粒体基因组的系统发育分析表明,它与 和 密切相关。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8b07/9307108/cc5ea1764d98/TMDN_A_2095232_F0001_C.jpg

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