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2007年印度-太平洋软珊瑚马努普蒂和范·奥夫韦根的完整线粒体基因组(八放珊瑚亚纲:海鸡冠目)

The complete mitochondrial genome of Indo-Pacific soft coral Manuputty and van Ofwegen, 2007 (Octocorallia: Alcyonacea).

作者信息

Yang Chaojie, Shikhsarmast Farnaz Mahmoudi, Fu Chunzheng, Shen Chun-Yang

机构信息

Key Laboratory of Utilization and Conservation for Tropical Marine Bioresources, Hainan Tropical Ocean University, Sanya, China.

Institute of Sericulture, Chengde Medical University, Chengde, Hebei, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2023 Mar 8;8(3):371-374. doi: 10.1080/23802359.2023.2184658. eCollection 2023.

Abstract

The complete mitochondrial genome (mitogenome) of the soft coral Manuputty and van Ofwegen, 2007 was sequenced and annotated using Illumina next-generation sequencing (NGS). The mitogenome of was 18,730 bp in length and consisted of 14 protein-coding genes (PCGs), two ribosomal RNA genes (rRNA), and only one transfer RNA gene (). The base composition was 30.18% A, 16.46% C, 19.35% G, and 34.00% T, with a total A + T content of 64.19%. The phylogenetic analysis demonstrated a close evolutionary relationship among , , and .

摘要

利用Illumina下一代测序(NGS)技术对2007年发现的软珊瑚Manuputty和van Ofwegen的完整线粒体基因组(有丝分裂基因组)进行了测序和注释。其有丝分裂基因组长度为18,730 bp,由14个蛋白质编码基因(PCG)、两个核糖体RNA基因(rRNA)和仅一个转运RNA基因()组成。碱基组成为30.18%的A、16.46%的C、19.35%的G和34.00%的T,A+T总含量为64.19%。系统发育分析表明,、和之间存在密切的进化关系。

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