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软珊瑚Ofwegen和贝纳亚胡的完整线粒体基因组,2012年(八放珊瑚亚纲:海鸡冠目):线粒体基因组组织与系统发育分析

The complete mitochondrial genome of soft coral Ofwegen and Benayahu, 2012 (Octocorallia: Alcyonacea): the analysis of mitogenome organization and phylogeny.

作者信息

Shen Chun-Yang, Wang Pei-Zheng, Xue Wei, Liu Zhao-Hui, Zhao Jing-Yi, Tong Xiao-Bo, Liu Chunwei, Wu Xiao-Fang, Mao Xiaonan, Tian Sihan, Fu Chunzheng

机构信息

Department of Biology, Chengde Medical University, Hebei Province, Chengde, PR China.

College of Ecology and Environment, Hainan Tropical Ocean University, Sanya, PR China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Apr 8;6(4):1348-1350. doi: 10.1080/23802359.2021.1906174.

Abstract

The complete mitochondrial genome of was sequenced and analyzed using next-generation sequencing. The present mitochondrial genome was 18730 bp in length, containing 14 protein-coding genes (PCGs) (-.-, , , , , and ), two ribosomal genes (s) ( and ), and one transfer gene (). The phylogenetic analysis of family Alcyoniidae revealed that . and cluster together. Five species in reveals high identity in mitogenome sequences that the lowest variable sites (SNPs) were found between . and . .

摘要

对[具体物种名称未给出]的完整线粒体基因组进行了测序,并使用下一代测序技术进行了分析。目前的线粒体基因组长度为18730 bp,包含14个蛋白质编码基因(PCGs)(-.-、[基因名称未完整给出]、[基因名称未完整给出]、[基因名称未完整给出]、[基因名称未完整给出]、[基因名称未完整给出]和[基因名称未完整给出])、两个核糖体RNA基因(rRNAs)([基因名称未完整给出]和[基因名称未完整给出])以及一个转移RNA基因(tRNA)([基因名称未完整给出])。海鳃科的系统发育分析表明,[具体物种名称未给出]和[具体物种名称未给出]聚集在一起。[具体属名未给出]中的五个物种在有丝分裂基因组序列中显示出高度的同一性,在[具体物种名称未给出]和[具体物种名称未给出]之间发现的可变位点(SNPs)最少。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0882/8043561/5b42bce2cda8/TMDN_A_1906174_F0001_B.jpg

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