• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
PyBioPAX: biological pathway exchange in Python.PyBioPAX:Python 中的生物途径交换
J Open Source Softw. 2022;7(71). doi: 10.21105/joss.04136. Epub 2022 Mar 11.
2
Integration of Python Modules in a MATLAB-Based Predictive Analytics Toolset for Healthcare.Python 模块在基于 MATLAB 的医疗保健预测分析工具集中的集成。
Stud Health Technol Inform. 2022 May 16;293:197-204. doi: 10.3233/SHTI220369.
3
A fast and efficient python library for interfacing with the Biological Magnetic Resonance Data Bank.一个用于与生物磁共振数据库接口的快速高效的Python库。
BMC Bioinformatics. 2017 Mar 17;18(1):175. doi: 10.1186/s12859-017-1580-5.
4
Thermoregulation in a brooding female Indian python, Python molurus bivittatus.雌性印度蟒(Python molurus bivittatus)孵卵期间的体温调节
Science. 1966 Feb 11;151(3711):694-6. doi: 10.1126/science.151.3711.694.
5
The role of python eggshell permeability dynamics in a respiration-hydration trade-off.蟒蛇蛋壳渗透动力学在呼吸 - 水合作用权衡中的作用。
Physiol Biochem Zool. 2010 Jul-Aug;83(4):576-86. doi: 10.1086/652425.
6
An intuitive Python interface for Bioconductor libraries demonstrates the utility of language translators.用于 Bioconductor 库的直观 Python 接口展示了语言翻译器的实用性。
BMC Bioinformatics. 2010 Dec 21;11 Suppl 12(Suppl 12):S11. doi: 10.1186/1471-2105-11-S12-S11.
7
Evidence that neurotensin mediates postprandial intestinal hyperemia in the python, Python regius.神经降压素介导球蟒(Python regius)餐后肠道充血的证据。
Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol. 2007 Sep;293(3):R1393-9. doi: 10.1152/ajpregu.00256.2007. Epub 2007 Jun 13.
8
Pycellerator: an arrow-based reaction-like modelling language for biological simulations.Pycellerator:一种用于生物模拟的基于箭头的类似反应的建模语言。
Bioinformatics. 2016 Feb 15;32(4):629-31. doi: 10.1093/bioinformatics/btv596. Epub 2015 Oct 26.
9
The zoonotic implications of pentastomiasis in the royal python (python regius).球蟒(Python regius)中舌形虫病的人畜共患病影响。
Ghana Med J. 2010 Sep;44(3):115-8. doi: 10.4314/gmj.v44i3.68895.
10
PyBERTHART: A Relativistic Real-Time Four-Component TDDFT Implementation Using Prototyping Techniques Based on Python.PyBERTHART:一种基于Python原型技术的相对论实时四分量含时密度泛函理论实现方法。
J Chem Theory Comput. 2020 Apr 14;16(4):2410-2429. doi: 10.1021/acs.jctc.0c00053. Epub 2020 Mar 9.

引用本文的文献

1
Fixing molecular complexes in BioPAX standards to enrich interactions and detect redundancies using semantic web technologies.使用语义网技术固定 BioPAX 标准中的分子复合物以丰富相互作用并检测冗余。
Bioinformatics. 2023 May 4;39(5). doi: 10.1093/bioinformatics/btad257.
2
Graph algorithms for predicting subcellular localization at the pathway level.用于预测途径水平亚细胞定位的图算法。
Pac Symp Biocomput. 2023;28:145-156. doi: 10.1142/9789811270611_0014.

本文引用的文献

1
PS4DR: a multimodal workflow for identification and prioritization of drugs based on pathway signatures.PS4DR:一种基于途径特征的药物识别和优先级排序的多模态工作流程。
BMC Bioinformatics. 2020 Jun 5;21(1):231. doi: 10.1186/s12859-020-03568-5.
2
BioPAX-Parser: parsing and enrichment analysis of BioPAX pathways.BioPAX-Parser:解析和富集分析 BioPAX 通路。
Bioinformatics. 2020 Aug 1;36(15):4377-4378. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa529.
3
The reactome pathway knowledgebase.Reactome 通路知识库。
Nucleic Acids Res. 2020 Jan 8;48(D1):D498-D503. doi: 10.1093/nar/gkz1031.
4
Pathway Commons 2019 Update: integration, analysis and exploration of pathway data.Pathway Commons 2019 更新:途径数据的整合、分析和探索。
Nucleic Acids Res. 2020 Jan 8;48(D1):D489-D497. doi: 10.1093/nar/gkz946.
5
Tellurium notebooks-An environment for reproducible dynamical modeling in systems biology.Tellurium notebooks—用于系统生物学中可重复动态建模的环境。
PLoS Comput Biol. 2018 Jun 15;14(6):e1006220. doi: 10.1371/journal.pcbi.1006220. eCollection 2018 Jun.
6
The BioCyc collection of microbial genomes and metabolic pathways.生物信息学循环(BioCyc)微生物基因组和代谢途径集合。
Brief Bioinform. 2019 Jul 19;20(4):1085-1093. doi: 10.1093/bib/bbx085.
7
From word models to executable models of signaling networks using automated assembly.使用自动化装配从单词模型到信号网络的可执行模型。
Mol Syst Biol. 2017 Nov 24;13(11):954. doi: 10.15252/msb.20177651.
8
PyBEL: a computational framework for Biological Expression Language.PyBEL:一种用于生物表达语言的计算框架。
Bioinformatics. 2018 Feb 15;34(4):703-704. doi: 10.1093/bioinformatics/btx660.
9
Extraction and analysis of signatures from the Gene Expression Omnibus by the crowd.大众对基因表达综合数据库中的特征进行提取和分析。
Nat Commun. 2016 Sep 26;7:12846. doi: 10.1038/ncomms12846.
10
BioASF: a framework for automatically generating executable pathway models specified in BioPAX.BioASF:一个用于自动生成以BioPAX指定的可执行通路模型的框架。
Bioinformatics. 2016 Jun 15;32(12):i60-i69. doi: 10.1093/bioinformatics/btw250.

PyBioPAX: biological pathway exchange in Python.

作者信息

Gyori Benjamin M, Hoyt Charles Tapley

机构信息

Laboratory of Systems Pharmacology, Harvard Medical School.

出版信息

J Open Source Softw. 2022;7(71). doi: 10.21105/joss.04136. Epub 2022 Mar 11.

DOI:10.21105/joss.04136
PMID:36071952
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9447860/
Abstract
摘要