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2007年在哈萨克斯坦分离出的一株甲型H3N8马流感病毒的全编码基因组序列

Complete Coding Genome Sequence of an Influenza A/H3N8 Equine Virus Isolated in Kazakhstan in 2007.

作者信息

Burashev Yerbol, Orynbayev Mukhit, Zakarya Kunsulu, Abduraimov Yergali, Kassenov Markhabat, Strochkov Vitaliy, Kozhabergenov Nurlan, Usserbayev Bekbolat, Melisbek Aibarys, Shirinbekov Meirzhan, Sypatay Nuradyl, Sultankulova Kulyaisan

机构信息

Research Institute for Biological Safety Problems (RIBSP), Gvardeyskiy, Kazakhstan.

Faculty of Biology and Biotechnology, Al-Farabi Kazakh National University, Almaty, Kazakhstan.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2022 Oct 20;11(10):e0114721. doi: 10.1128/mra.01147-21. Epub 2022 Sep 12.

DOI:10.1128/mra.01147-21
PMID:36094178
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9584301/
Abstract

Here, we reported the complete coding sequence of the influenza A/equine/Otar/3/2007 (H3N8) equine virus, first isolated in Kazakhstan in 2007. The hemagglutinin (HA) sequences of the Kazakhstan isolates appeared to be closely related to viruses isolated in early 2000 in Asia. Phylogenetic analysis characterized the Kazakhstan isolates as a member of the Florida sublineage clade 2 by the HA protein sequence.

摘要

在此，我们报告了2007年首次在哈萨克斯坦分离出的甲型/马/奥塔尔/3/2007（H3N8）马流感病毒的完整编码序列。哈萨克斯坦分离株的血凝素（HA）序列似乎与2000年初在亚洲分离出的病毒密切相关。系统发育分析通过HA蛋白序列将哈萨克斯坦分离株鉴定为佛罗里达亚系分支2的一个成员。

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