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通过牛津纳米孔测序对全长 16S 核糖体 RNA 基因分析进行恙虫病的直接诊断。

Direct diagnosis of scrub typhus by full-length 16S ribosomal RNA gene analysis using Oxford Nanopore sequencing.

机构信息

Department of Internal Medicine, Postgraduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, India.

Department of Medical Microbiology, Postgraduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, India.

出版信息

Int J Infect Dis. 2022 Dec;125:132-134. doi: 10.1016/j.ijid.2022.10.040. Epub 2022 Nov 1.

DOI:10.1016/j.ijid.2022.10.040
PMID:36332903
Abstract

Scrub typhus (caused by Orientia tsutsugamushi) is a neglected and underdiagnosed disease due to its non-specific clinical presentation and challenging diagnostics. We document the first study of direct diagnosis of scrub typhus from the blood sample of a patient by full-length 16S ribosomal RNA gene amplicon analysis using Oxford Nanopore sequencing.

摘要

恙虫病(由恙虫东方体引起)由于其非特异性临床表现和诊断困难,是一种被忽视和诊断不足的疾病。我们通过 Oxford Nanopore 测序的全长 16S 核糖体 RNA 基因扩增子分析,从患者的血液样本中直接诊断恙虫病,这是首例此类研究。

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引用本文的文献

1
Application of Nanopore Sequencing in the Diagnosis and Treatment of Pulmonary Infections.纳米孔测序在肺部感染诊治中的应用。
Mol Diagn Ther. 2023 Nov;27(6):685-701. doi: 10.1007/s40291-023-00669-8. Epub 2023 Aug 11.