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从北太平洋亚热带环流的HetDA富集培养物中分离出的一种α-变形菌的宏基因组组装基因组。

Metagenome-Assembled Genome of an Alphaproteobacterium Isolated from an HetDA Enrichment from the North Pacific Subtropical Gyre.

作者信息

Santillan Martin, Graham Elaina D, Heidelberg John F, Webb Eric A

机构信息

Department of Biological Sciences, University of Southern California, Los Angeles, California, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2023 Feb 16;12(2):e0059522. doi: 10.1128/mra.00595-22. Epub 2023 Jan 31.

DOI:10.1128/mra.00595-22
PMID:36719246
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9933672/
Abstract

Here, we present HetDA_MAG_SS10, a metagenome-assembled genome (MAG) from an enrichment of a heterocystous diazotroph originally living in association with spp. obtained near Station ALOHA in the North Pacific Ocean. HetDA_MAG_SS10, an alphaproteobacterium in the order , is proposed to be photoheterotrophic via rhodopsin and has the potential for dimethylsulfoniopropionate (DMSP) demethylation.

摘要

在此，我们展示了HetDA_MAG_SS10，这是一个通过富集原本与 属物种共生的异形胞固氮菌而获得的宏基因组组装基因组（MAG），该物种是在北太平洋的ALOHA站附近获取的。HetDA_MAG_SS10属于 目下的α-变形菌，推测其通过视紫红质进行光能异养，并具有二甲基巯基丙酸内盐（DMSP）去甲基化的潜力。