• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

利用 cryoEM 对与癌症相关的 TCR-CD3 和肽-MHC 复合物进行结构分析。

Structural analysis of cancer-relevant TCR-CD3 and peptide-MHC complexes by cryoEM.

机构信息

Regeneron Pharmaceuticals, Inc., Tarrytown, NY, 10591, USA.

出版信息

Nat Commun. 2023 Apr 26;14(1):2401. doi: 10.1038/s41467-023-37532-7.

DOI:10.1038/s41467-023-37532-7
PMID:37100770
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10132440/
Abstract

The recognition of antigenic peptide-MHC (pMHC) molecules by T-cell receptors (TCR) initiates the T-cell mediated immune response. Structural characterization is key for understanding the specificity of TCR-pMHC interactions and informing the development of therapeutics. Despite the rapid rise of single particle cryoelectron microscopy (cryoEM), x-ray crystallography has remained the preferred method for structure determination of TCR-pMHC complexes. Here, we report cryoEM structures of two distinct full-length α/β TCR-CD3 complexes bound to their pMHC ligand, the cancer-testis antigen HLA-A2/MAGEA4 (230-239). We also determined cryoEM structures of pMHCs containing MAGEA4 (230-239) peptide and the closely related MAGEA8 (232-241) peptide in the absence of TCR, which provided a structural explanation for the MAGEA4 preference displayed by the TCRs. These findings provide insights into the TCR recognition of a clinically relevant cancer antigen and demonstrate the utility of cryoEM for high-resolution structural analysis of TCR-pMHC interactions.

摘要

T 细胞受体 (TCR) 识别抗原肽-MHC (pMHC) 分子,启动 T 细胞介导的免疫反应。结构特征对于理解 TCR-pMHC 相互作用的特异性以及指导治疗药物的开发至关重要。尽管单颗粒冷冻电子显微镜 (cryoEM) 的快速发展,但 X 射线晶体学仍然是 TCR-pMHC 复合物结构测定的首选方法。在这里,我们报告了两种不同全长 α/β TCR-CD3 复合物与它们的 pMHC 配体 HLA-A2/MAGEA4(230-239)结合的 cryoEM 结构。我们还确定了在没有 TCR 的情况下含有 MAGEA4(230-239)肽和密切相关的 MAGEA8(232-241)肽的 pMHC 的 cryoEM 结构,这为 TCR 显示的 MAGEA4 偏好提供了结构解释。这些发现为 TCR 对临床相关癌症抗原的识别提供了深入了解,并展示了 cryoEM 在 TCR-pMHC 相互作用的高分辨率结构分析中的应用。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/fa3f9cd416d4/41467_2023_37532_Fig5_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/1c3315a19be1/41467_2023_37532_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/5f736c273a51/41467_2023_37532_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/24aad36e1390/41467_2023_37532_Fig3_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/f99e282695bd/41467_2023_37532_Fig4_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/fa3f9cd416d4/41467_2023_37532_Fig5_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/1c3315a19be1/41467_2023_37532_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/5f736c273a51/41467_2023_37532_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/24aad36e1390/41467_2023_37532_Fig3_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/f99e282695bd/41467_2023_37532_Fig4_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6a77/10133266/fa3f9cd416d4/41467_2023_37532_Fig5_HTML.jpg

相似文献

1
Structural analysis of cancer-relevant TCR-CD3 and peptide-MHC complexes by cryoEM.利用 cryoEM 对与癌症相关的 TCR-CD3 和肽-MHC 复合物进行结构分析。
Nat Commun. 2023 Apr 26;14(1):2401. doi: 10.1038/s41467-023-37532-7.
2
MPID-T: database for sequence-structure-function information on T-cell receptor/peptide/MHC interactions.MPID-T:T细胞受体/肽/MHC相互作用的序列-结构-功能信息数据库。
Appl Bioinformatics. 2006;5(2):111-4. doi: 10.2165/00822942-200605020-00005.
3
A flexible docking approach for prediction of T cell receptor-peptide-MHC complexes.一种用于预测 T 细胞受体-肽-MHC 复合物的柔性对接方法。
Protein Sci. 2013 Jan;22(1):35-46. doi: 10.1002/pro.2181.
4
T-cell receptor (TCR)-peptide specificity overrides affinity-enhancing TCR-major histocompatibility complex interactions.T细胞受体(TCR)-肽特异性超越了增强亲和力的TCR-主要组织相容性复合体相互作用。
J Biol Chem. 2014 Jan 10;289(2):628-38. doi: 10.1074/jbc.M113.522110. Epub 2013 Nov 6.
5
A structural-based machine learning method to classify binding affinities between TCR and peptide-MHC complexes.一种基于结构的机器学习方法,用于分类 TCR 与肽-MHC 复合物之间的结合亲和力。
Mol Immunol. 2021 Nov;139:76-86. doi: 10.1016/j.molimm.2021.07.020. Epub 2021 Aug 26.
6
Probing the Conformational Dynamics of Affinity-Enhanced T Cell Receptor Variants upon Binding the Peptide-Bound Major Histocompatibility Complex by Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry.通过氢/氘交换质谱法探测结合肽结合主要组织相容性复合物后亲和力增强的 T 细胞受体变体的构象动态。
Biochemistry. 2021 Mar 23;60(11):859-872. doi: 10.1021/acs.biochem.1c00035. Epub 2021 Mar 9.
7
The Full Model of the pMHC-TCR-CD3 Complex: A Structural and Dynamical Characterization of Bound and Unbound States.pMHC-TCR-CD3 复合物的全模型:结合态和游离态的结构与动态特征描述。
Cells. 2022 Feb 14;11(4):668. doi: 10.3390/cells11040668.
8
Structure of a fully assembled tumor-specific T cell receptor ligated by pMHC.完全组装的肿瘤特异性 T 细胞受体与 pMHC 连接的结构。
Cell. 2022 Aug 18;185(17):3201-3213.e19. doi: 10.1016/j.cell.2022.07.010.
9
Structural and thermodynamic correlates of T cell signaling.T细胞信号传导的结构与热力学关联
Annu Rev Biophys Biomol Struct. 2002;31:121-49. doi: 10.1146/annurev.biophys.31.082901.134423. Epub 2001 Oct 25.
10
Computationally profiling peptide:MHC recognition by T-cell receptors and T-cell receptor-mimetic antibodies.通过 T 细胞受体和 T 细胞受体模拟抗体计算分析肽:MHC 识别。
Front Immunol. 2023 Jan 9;13:1080596. doi: 10.3389/fimmu.2022.1080596. eCollection 2022.

引用本文的文献

1
TCR-pMHC Binding Specificity Prediction From Structure Using Graph Neural Networks.基于结构利用图神经网络预测TCR-pMHC结合特异性
IEEE Trans Comput Biol Bioinform. 2025 Jan-Feb;22(1):171-179. doi: 10.1109/TCBBIO.2024.3504235.
2
Three-Dimensional Modeling of T Cell Receptor Gamma (TRG)_Delta (TRD)/CD1D Complex Reveals Different Binding Interactions Depending on the TRD CDR3 Length.T细胞受体γ(TRG)-δ(TRD)/CD1D复合物的三维建模揭示了取决于TRD互补决定区3(CDR3)长度的不同结合相互作用。
Antibodies (Basel). 2025 May 29;14(2):46. doi: 10.3390/antib14020046.
3
Big Data Science on T Cell Receptor-mediated Immune Regulation.

本文引用的文献

1
Structure of a fully assembled tumor-specific T cell receptor ligated by pMHC.完全组装的肿瘤特异性 T 细胞受体与 pMHC 连接的结构。
Cell. 2022 Aug 18;185(17):3201-3213.e19. doi: 10.1016/j.cell.2022.07.010.
2
Tebentafusp: First Approval.特泊替尼:首次获批。
Drugs. 2022 Apr;82(6):703-710. doi: 10.1007/s40265-022-01704-4.
3
Cholesterol inhibits TCR signaling by directly restricting TCR-CD3 core tunnel motility.胆固醇通过直接限制 TCR-CD3 核心管的迁移运动来抑制 TCR 信号转导。
T细胞受体介导的免疫调节中的大数据科学
JMA J. 2025 Apr 28;8(2):338-344. doi: 10.31662/jmaj.2024-0304. Epub 2025 Mar 21.
4
The Structural Biology of T-Cell Antigen Detection at Close Contacts.紧密接触时T细胞抗原检测的结构生物学
Immunol Rev. 2025 May;331(1):e70014. doi: 10.1111/imr.70014.
5
Identification and biophysical characterization of Plasmodium peptide binding by common African HLAs.常见非洲人HLA对疟原虫肽结合的鉴定及生物物理特性分析
Sci Rep. 2025 Mar 12;15(1):8614. doi: 10.1038/s41598-025-92191-6.
6
Structural characterization of two γδ TCR/CD3 complexes.两种γδ TCR/CD3复合物的结构表征
Nat Commun. 2025 Jan 2;16(1):318. doi: 10.1038/s41467-024-55467-5.
7
Targeting cancer with precision: strategical insights into TCR-engineered T cell therapies.精准靶向癌症:TCR工程化T细胞疗法的策略性见解
Theranostics. 2025 Jan 1;15(1):300-323. doi: 10.7150/thno.104594. eCollection 2025.
8
TCellR2Vec: efficient feature selection for TCR sequences for cancer classification.TCellR2Vec:用于癌症分类的TCR序列的高效特征选择
PeerJ Comput Sci. 2024 Nov 4;10:e2239. doi: 10.7717/peerj-cs.2239. eCollection 2024.
9
In situ cell-surface conformation of the TCR-CD3 signaling complex.TCR-CD3信号复合物的原位细胞表面构象。
EMBO Rep. 2024 Dec;25(12):5719-5742. doi: 10.1038/s44319-024-00314-3. Epub 2024 Nov 7.
10
Mechanical force matters in early T cell activation.机械力在早期 T 细胞激活中很重要。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Sep 10;121(37):e2404748121. doi: 10.1073/pnas.2404748121. Epub 2024 Sep 6.
Mol Cell. 2022 Apr 7;82(7):1278-1287.e5. doi: 10.1016/j.molcel.2022.02.017. Epub 2022 Mar 9.
4
TCR-T Immunotherapy: The Challenges and Solutions.TCR-T免疫疗法:挑战与解决方案
Front Oncol. 2022 Jan 25;11:794183. doi: 10.3389/fonc.2021.794183. eCollection 2021.
5
Humanization of T cell-mediated immunity in mice.在小鼠中实现 T 细胞介导免疫的人源化。
Sci Immunol. 2021 Dec 17;6(66):eabj4026. doi: 10.1126/sciimmunol.abj4026.
6
T cell receptor (TCR) signaling in health and disease.T 细胞受体 (TCR) 在健康和疾病中的信号转导。
Signal Transduct Target Ther. 2021 Dec 13;6(1):412. doi: 10.1038/s41392-021-00823-w.
7
Overall Survival Benefit with Tebentafusp in Metastatic Uveal Melanoma.特普替尼治疗转移性葡萄膜黑色素瘤的总生存获益。
N Engl J Med. 2021 Sep 23;385(13):1196-1206. doi: 10.1056/NEJMoa2103485.
8
T-cell receptor-based therapy: an innovative therapeutic approach for solid tumors.基于 T 细胞受体的治疗:实体瘤的创新治疗方法。
J Hematol Oncol. 2021 Jun 30;14(1):102. doi: 10.1186/s13045-021-01115-0.
9
Canonical T cell receptor docking on peptide-MHC is essential for T cell signaling.典型的T细胞受体与肽-主要组织相容性复合体对接对于T细胞信号传导至关重要。
Science. 2021 Jun 4;372(6546). doi: 10.1126/science.abe9124.
10
Tumor rejection properties of gp100-specific T cells correlate with T cell receptor binding affinity towards the wild type rather than anchor-modified antigen.gp100 特异性 T 细胞的肿瘤排斥特性与其针对野生型而非锚定修饰抗原的 TCR 结合亲和力相关。
Mol Immunol. 2021 Jul;135:365-372. doi: 10.1016/j.molimm.2021.05.001. Epub 2021 May 11.