• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

GFAP: ultrafast and accurate gene functional annotation software for plants.

作者信息

Xu Dong, Yang Yingxue, Gong Desheng, Chen Xiaojian, Jin Kangming, Jiang Heling, Yu Wenjuan, Li Jihong, Zhang Jin, Pan Weihua

机构信息

Shenzhen Branch, Guangdong Laboratory of Lingnan Modern Agriculture, Genome Analysis Laboratory of the Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Agricultural Genomics Institute at Shenzhen, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shenzhen 518120, China.

State Key Laboratory of Subtropical Silviculture, College of Forestry and Biotechnology, Zhejiang A&F University, Hangzhou, Zhejiang 311300, China.

出版信息

Plant Physiol. 2023 Oct 26;193(3):1745-1748. doi: 10.1093/plphys/kiad393.

DOI:10.1093/plphys/kiad393
PMID:37403633
Abstract
摘要

相似文献

1
GFAP: ultrafast and accurate gene functional annotation software for plants.GFAP:用于植物的超快速且准确的基因功能注释软件。
Plant Physiol. 2023 Oct 26;193(3):1745-1748. doi: 10.1093/plphys/kiad393.
2
TOA: A software package for automated functional annotation in non-model plant species.TOA:用于非模式植物物种自动功能注释的软件包。
Mol Ecol Resour. 2021 Feb;21(2):621-636. doi: 10.1111/1755-0998.13285. Epub 2020 Nov 18.
3
Computational Methods for Pseudogene Annotation Based on Sequence Homology.基于序列同源性的假基因注释计算方法。
Methods Mol Biol. 2021;2324:35-48. doi: 10.1007/978-1-0716-1503-4_3.
4
Computational methods for pseudogene annotation based on sequence homology.基于序列同源性的假基因注释计算方法。
Methods Mol Biol. 2014;1167:27-39. doi: 10.1007/978-1-4939-0835-6_3.
5
FA-nf: A Functional Annotation Pipeline for Proteins from Non-Model Organisms Implemented in Nextflow.FA-nf:一种用Nextflow实现的针对非模式生物蛋白质的功能注释流程
Genes (Basel). 2021 Oct 19;12(10):1645. doi: 10.3390/genes12101645.
6
SynGAP: a synteny-based toolkit for gene structure annotation polishing.SynGAP:基于基因结构注释优化的同线性分析工具包。
Genome Biol. 2024 Aug 13;25(1):218. doi: 10.1186/s13059-024-03359-8.
7
ShortStack: comprehensive annotation and quantification of small RNA genes.ShortStack:小 RNA 基因的全面注释和定量分析。
RNA. 2013 Jun;19(6):740-51. doi: 10.1261/rna.035279.112. Epub 2013 Apr 22.
8
Hayai-Annotation Plants: an ultra-fast and comprehensive functional gene annotation system in plants.海牙注释植物:一个超快速和全面的植物功能基因注释系统。
Bioinformatics. 2019 Nov 1;35(21):4427-4429. doi: 10.1093/bioinformatics/btz380.
9
Biological Interpretation of Complex Genomic Data.复杂基因组数据的生物学解释
Methods Mol Biol. 2019;1908:61-71. doi: 10.1007/978-1-4939-9004-7_5.
10
Genomic Annotation Resources in R/Bioconductor.R/Bioconductor中的基因组注释资源
Methods Mol Biol. 2016;1418:67-90. doi: 10.1007/978-1-4939-3578-9_4.

引用本文的文献

1
Functional Identification and Transcriptional Activity Analysis of Gene.基因的功能鉴定与转录活性分析
Plants (Basel). 2025 Jul 15;14(14):2190. doi: 10.3390/plants14142190.
2
A gap-free reference genome of Populus deltoides provides insights into karyotype evolution of Salicaceae.美洲黑杨的无间隙参考基因组为杨柳科核型进化提供了见解。
BMC Biol. 2025 Jul 7;23(1):201. doi: 10.1186/s12915-025-02304-w.
3
Integrative multi-omics data provide insights into the biosynthesis of furanocoumarins and mechanisms regulating their accumulation in Angelica dahurica.
整合多组学数据为深入了解白芷中呋喃香豆素的生物合成及其积累调控机制提供了线索。
Commun Biol. 2025 Apr 23;8(1):649. doi: 10.1038/s42003-025-08076-x.
4
A Guide to Metabolic Network Modeling for Plant Biology.植物生物学代谢网络建模指南
Plants (Basel). 2025 Feb 6;14(3):484. doi: 10.3390/plants14030484.
5
Chromosome level genome assembly of 'Wanfeng' almond (Prunus dulcis).‘万丰’扁桃(Prunus dulcis)的染色体水平基因组组装
Sci Data. 2025 Jan 30;12(1):179. doi: 10.1038/s41597-025-04480-4.
6
Chromosome-level genome assembly of Pontederia cordata L. provides insights into its rapid adaptation and variation of flower colours.梭鱼草的染色体水平基因组组装为其快速适应和花色变异提供了见解。
DNA Res. 2025 Mar 1;32(2). doi: 10.1093/dnares/dsaf002.
7
Genome-wide identification of the ATP-dependent zinc metalloprotease (FtsH) in Triticeae species reveals that TaFtsH-1 regulates cadmium tolerance in Triticum aestivum.小麦族物种中ATP依赖型锌金属蛋白酶(FtsH)的全基因组鉴定表明,TaFtsH-1调控普通小麦的镉耐受性。
PLoS One. 2024 Dec 31;19(12):e0316486. doi: 10.1371/journal.pone.0316486. eCollection 2024.
8
A telomere-to-telomere gap-free reference genome of provides insights into the molecular mechanism underlying petal shape changes.一个端粒到端粒无间隙的参考基因组为花瓣形状变化背后的分子机制提供了见解。
Hortic Res. 2024 Sep 3;11(12):uhae249. doi: 10.1093/hr/uhae249. eCollection 2024 Dec.
9
First genome assembly and characterization of .首次对……进行基因组组装和特征分析。 (原句不完整,翻译可能不太准确,需结合完整内容理解)
Front Plant Sci. 2024 Oct 29;15:1456102. doi: 10.3389/fpls.2024.1456102. eCollection 2024.
10
Functional Identification and Regulatory Active Site Screening of the Gene of ..基因的功能鉴定与调控活性位点筛选
Plants (Basel). 2024 Sep 21;13(18):2647. doi: 10.3390/plants13182647.