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cyjShiny:一个 cytoscape.js R Shiny 小部件,用于网络可视化和分析。

cyjShiny: A cytoscape.js R Shiny Widget for network visualization and analysis.

机构信息

Department of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA, United States of America.

Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA, United States of America.

出版信息

PLoS One. 2023 Aug 16;18(8):e0285339. doi: 10.1371/journal.pone.0285339. eCollection 2023.

DOI:10.1371/journal.pone.0285339
PMID:37585474
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10431631/
Abstract

cyjShiny is an open-source R package that allows users to embed network visualization into Shiny apps and R Markdown documents. cyjShiny (https://github.com/cytoscape/cyjShiny) builds on the cytoscape.js Javascript graph library. Additionally, the package provides helper functions to convert common R data representations (e.g., data.frame) into forms compatible with cytoscape.js.

摘要

cyjShiny 是一个开源的 R 包,允许用户将网络可视化嵌入到 Shiny 应用程序和 R Markdown 文档中。cyjShiny(https://github.com/cytoscape/cyjShiny)构建在 cytoscape.js JavaScript 图形库之上。此外,该包还提供了一些辅助函数,可以将常见的 R 数据表示形式(例如 data.frame)转换为与 cytoscape.js 兼容的形式。

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