Suppr超能文献

空间转录组学数据共享标准。

A standard for sharing spatial transcriptomics data.

作者信息

Jackson Kayla C, Pachter Lior

机构信息

Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA, USA.

Division of Biology and Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, CA, USA.

出版信息

Cell Genom. 2023 Aug 9;3(8):100374. doi: 10.1016/j.xgen.2023.100374.

Abstract

Spatial transcriptomic technologies have the potential to reveal critical relationships between the function of genes and cells and their spatial organization. Here, we provide a sharing model for spatial transcriptomics data with the aim of establishing a set of primary data and metadata needed to reproduce analyses and facilitate computational methods development.

摘要

空间转录组技术有潜力揭示基因和细胞功能与其空间组织之间的关键关系。在此,我们提供一个空间转录组学数据的共享模型,旨在建立一组用于重现分析和促进计算方法开发所需的原始数据和元数据。

相似文献

1
A standard for sharing spatial transcriptomics data.空间转录组学数据共享标准。
Cell Genom. 2023 Aug 9;3(8):100374. doi: 10.1016/j.xgen.2023.100374.
2
Computational solutions for spatial transcriptomics.空间转录组学的计算解决方案。
Comput Struct Biotechnol J. 2022 Sep 1;20:4870-4884. doi: 10.1016/j.csbj.2022.08.043. eCollection 2022.
5
A Review of the Application of Spatial Transcriptomics in Neuroscience.空间转录组学在神经科学中的应用综述。
Interdiscip Sci. 2024 Jun;16(2):243-260. doi: 10.1007/s12539-024-00603-4. Epub 2024 Feb 20.
9
A practical guide to spatial transcriptomics.空间转录组学实用指南
Mol Aspects Med. 2024 Jun;97:101276. doi: 10.1016/j.mam.2024.101276. Epub 2024 May 21.

本文引用的文献

3
Museum of spatial transcriptomics.空间转录组学博物馆。
Nat Methods. 2022 May;19(5):534-546. doi: 10.1038/s41592-022-01409-2. Epub 2022 Mar 10.
6
The European Genome-phenome Archive in 2021.2021 年的欧洲基因组-表型数据库。
Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7;50(D1):D980-D987. doi: 10.1093/nar/gkab1059.

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验