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Sequence similarity ('homology') searching for molecular biologists.

作者信息

Davison D

出版信息

Bull Math Biol. 1985;47(4):437-74. doi: 10.1007/BF02460006.

DOI:10.1007/BF02460006
PMID:3841292
Abstract
摘要

相似文献

1
Sequence similarity ('homology') searching for molecular biologists.面向分子生物学家的序列相似性（“同源性”）搜索。
Bull Math Biol. 1985;47(4):437-74. doi: 10.1007/BF02460006.
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Sequence comparison by exponentially-damped alignment.通过指数衰减比对进行序列比较。
Nucleic Acids Res. 1984 Jan 11;12(1 Pt 2):457-64. doi: 10.1093/nar/12.1part2.457.
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A comprehensive package for DNA sequence analysis in FORTRAN IV for the PDP-11.一个用于PDP - 11的FORTRAN IV语言的DNA序列分析综合程序包。
Nucleic Acids Res. 1986 Jan 10;14(1):239-54. doi: 10.1093/nar/14.1.239.
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Computer methods to locate signals in nucleic acid sequences.在核酸序列中定位信号的计算机方法。
Nucleic Acids Res. 1984 Jan 11;12(1 Pt 2):505-19. doi: 10.1093/nar/12.1part2.505.
5
Definition and identification of homology domains.同源结构域的定义与鉴定
Comput Appl Biosci. 1988 Mar;4(1):25-33. doi: 10.1093/bioinformatics/4.1.25.
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Quantitative computer analysis of signal sequence homologies in DNA.
Comput Appl Biosci. 1986 Dec;2(4):269-75. doi: 10.1093/bioinformatics/2.4.269.
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Nucleic Acids Res. 1992 Jan 11;20(1):131-6. doi: 10.1093/nar/20.1.131.
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Enlarged similarity of nucleic acid sequences.
DNA Res. 1996 Jun 30;3(3):157-64. doi: 10.1093/dnares/3.3.157.
9
A fast homology program for aligning biological sequences.一种用于比对生物序列的快速同源性程序。
Nucleic Acids Res. 1984 Jan 11;12(1 Pt 2):447-55. doi: 10.1093/nar/12.1part2.447.
10
Nucleic acid sequence analysis software packages.
Curr Opin Biotechnol. 1994 Feb;5(1):19-23. doi: 10.1016/s0958-1669(05)80064-3.

引用本文的文献

1
A multiple sequence alignment program.一个多序列比对程序。
Nucleic Acids Res. 1986 Jan 10;14(1):363-74. doi: 10.1093/nar/14.1.363.
2
A survey of multiple sequence comparison methods.多序列比对方法综述。
Bull Math Biol. 1992 Jul;54(4):563-98. doi: 10.1007/BF02459635.

本文引用的文献

1
Sequence alignments in the neighborhood of the optimum with general application to dynamic programming.最优邻域序列比对及其在动态规划中的广泛应用。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1983 May;80(10):3123-4. doi: 10.1073/pnas.80.10.3123.
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Nucleic Acids Res. 1980 Oct 10;8(19):4545-62. doi: 10.1093/nar/8.19.4545.
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Comparative biosequence metrics.比较生物序列度量
J Mol Evol. 1981;18(1):38-46. doi: 10.1007/BF01733210.
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J Mol Biol. 1981 Mar 25;147(1):195-7. doi: 10.1016/0022-2836(81)90087-5.
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An improved algorithm for matching biological sequences.一种用于匹配生物序列的改进算法。
J Mol Biol. 1982 Dec 15;162(3):705-8. doi: 10.1016/0022-2836(82)90398-9.
7
A DNA sequence handling program.一个DNA序列处理程序。
Nucleic Acids Res. 1982 Jan 11;10(1):61-7. doi: 10.1093/nar/10.1.61.
8
SEQ: a nucleotide sequence analysis and recombination system.SEQ：一种核苷酸序列分析与重组系统。
Nucleic Acids Res. 1982 Jan 11;10(1):279-94. doi: 10.1093/nar/10.1.279.
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Nucleic Acids Res. 1982 May 11;10(9):2997-3011. doi: 10.1093/nar/10.9.2997.
10
An efficient method for finding repeats in molecular sequences.一种在分子序列中查找重复序列的有效方法。
Nucleic Acids Res. 1983 Jul 11;11(13):4629-34. doi: 10.1093/nar/11.13.4629.