• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

转运RNA循环及其与蛋白质合成速率的关系。

The tRNA cycle and its relation to the rate of protein synthesis.

作者信息

Liljenström H, von Heijne G, Blomberg C, Johansson J

出版信息

Eur Biophys J. 1985;12(2):115-9. doi: 10.1007/BF00260434.

DOI:10.1007/BF00260434
PMID:4017983
Abstract

With the aid of a kinetic model, we have investigated how the adaptation between the various components of the tRNA cycle and the codon frequencies affects the rate of protein synthesis. Depending on the relative amounts of total tRNA, synthetase and ribosomes, the optimal correlations vary between a situation where all tRNA species are either present in equal amounts or are present in amounts proportional to the square-root of the corresponding codon frequencies, and a situation where the amounts of the different tRNA species present are linearly proportional to the codon frequencies.

摘要

借助动力学模型,我们研究了tRNA循环各组分与密码子频率之间的适应性如何影响蛋白质合成速率。根据总tRNA、合成酶和核糖体的相对量,最佳相关性在以下两种情况之间变化:一种情况是所有tRNA种类以等量存在或以与相应密码子频率的平方根成比例的量存在;另一种情况是存在的不同tRNA种类的量与密码子频率成线性比例。

相似文献

1
The tRNA cycle and its relation to the rate of protein synthesis.转运RNA循环及其与蛋白质合成速率的关系。
Eur Biophys J. 1985;12(2):115-9. doi: 10.1007/BF00260434.
2
Protein Synthesis in E. coli: Dependence of Codon-Specific Elongation on tRNA Concentration and Codon Usage.大肠杆菌中的蛋白质合成:密码子特异性延伸对tRNA浓度和密码子使用的依赖性。
PLoS One. 2015 Aug 13;10(8):e0134994. doi: 10.1371/journal.pone.0134994. eCollection 2015.
3
[Interaction of tRNA with ribosomes].[转运RNA与核糖体的相互作用]
Mol Biol (Mosk). 1984 Sep-Oct;18(5):1249-63.
4
Selective charging of tRNA isoacceptors explains patterns of codon usage.tRNA 同工受体的选择性充电解释了密码子使用模式。
Science. 2003 Jun 13;300(5626):1718-22. doi: 10.1126/science.1083811.
5
[tRNA adaptation and the optimization of translation].[转运RNA适配与翻译优化]
Reprod Nutr Dev (1980). 1981;21(2):177-83.
6
Uncharged tRNA error damping model.非带电转运RNA错误抑制模型。
FEBS Lett. 1986 Oct 6;206(2):185-8. doi: 10.1016/0014-5793(86)80977-2.
7
Allosteric mechanism for codon-dependent tRNA selection on ribosomes.核糖体上密码子依赖性tRNA选择的变构机制。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1975 Nov;72(11):4248-51. doi: 10.1073/pnas.72.11.4248.
8
The transorientation hypothesis for codon recognition during protein synthesis.蛋白质合成过程中密码子识别的反式取向假说。
Nature. 2002 Mar 21;416(6878):281-5. doi: 10.1038/416281a.
9
[tRNA-binding centers of Escherichia coli ribosomes and their structural organization].[大肠杆菌核糖体的tRNA结合中心及其结构组织]
Mol Biol (Mosk). 1984 Sep-Oct;18(5):1194-207.
10
Accuracy of tRNA charging and codon: anticodon recognition; relative importance for cellular stability.tRNA 氨基酸负载及密码子:反密码子识别的准确性;对细胞稳定性的相对重要性。
J Theor Biol. 1993 Feb 21;160(4):493-508. doi: 10.1006/jtbi.1993.1032.

引用本文的文献

1
The essence of life revisited: how theories can shed light on it.生命本质再探:理论如何为之增光添彩。
Theory Biosci. 2022 Jun;141(2):105-123. doi: 10.1007/s12064-021-00342-w. Epub 2021 May 6.
2
Ligand-dependent tRNA processing by a rationally designed RNase P riboswitch.由合理设计的 RNase P 核糖开关进行配体依赖性 tRNA 加工。
Nucleic Acids Res. 2021 Feb 22;49(3):1784-1800. doi: 10.1093/nar/gkaa1282.
3
Decoding properties of tRNA leave a detectable signal in codon usage bias.tRNA 解码性质在密码子使用偏好中留下可检测的信号。

本文引用的文献

1
Does quantitative tRNA adaptation to codon content in mRNA optimize the ribosomal translation efficiency? Proposal for a translation system model.tRNA对mRNA密码子含量的定量适应是否能优化核糖体翻译效率?一种翻译系统模型的提议。
Biochimie. 1981 Mar;63(3):187-95. doi: 10.1016/s0300-9084(81)80192-7.
2
Polypeptide elongation and tRNA cycling in Escherichia coli: a dynamic approach.大肠杆菌中的多肽延伸与tRNA循环:一种动态研究方法
FEBS Lett. 1980 Jun 30;115(2):151-5. doi: 10.1016/0014-5793(80)81155-0.
3
Costs of accuracy determined by a maximal growth rate constraint.
Bioinformatics. 2012 Sep 15;28(18):i340-i348. doi: 10.1093/bioinformatics/bts403.
4
Balanced codon usage optimizes eukaryotic translational efficiency.碱基组合的平衡性优化了真核生物的翻译效率。
PLoS Genet. 2012;8(3):e1002603. doi: 10.1371/journal.pgen.1002603. Epub 2012 Mar 29.
5
Genes adopt non-optimal codon usage to generate cell cycle-dependent oscillations in protein levels.基因采用非最优密码子使用来产生细胞周期依赖性的蛋白质水平振荡。
Mol Syst Biol. 2012 Feb 28;8:572. doi: 10.1038/msb.2012.3.
由最大增长率约束确定的准确性成本。
Q Rev Biophys. 1984 Feb;17(1):45-82. doi: 10.1017/s0033583500005254.
4
Optimization of translation accuracy.翻译准确性的优化。
Prog Nucleic Acid Res Mol Biol. 1984;31:191-219. doi: 10.1016/s0079-6603(08)60378-5.
5
Free energy cost and accuracy in branched selection processes of biosynthesis.
Q Rev Biophys. 1983 Nov;16(4):415-519. doi: 10.1017/s0033583500005205.
6
Correlation between the abundance of Escherichia coli transfer RNAs and the occurrence of the respective codons in its protein genes.大肠杆菌转移RNA丰度与其蛋白质基因中相应密码子出现情况之间的相关性。
J Mol Biol. 1981 Feb 15;146(1):1-21. doi: 10.1016/0022-2836(81)90363-6.
7
Functional adaptation of tRNA population.tRNA群体的功能适应性
J Theor Biol. 1974 Jan;43(1):211-25. doi: 10.1016/s0022-5193(74)80054-8.
8
The concentration dependence of the error frequencies and some related quantities in protein synthesis.
J Theor Biol. 1979 May 7;78(1):113-20. doi: 10.1016/0022-5193(79)90329-1.