Suppr超能文献

从猪回肠分离出的一种潜在益生菌乳酸菌的基因组评估。

genome assessment of , a potential probiotic lactic acid bacterium isolated from porcine Ileum.

作者信息

Matjuda Dikonketso Shirleymay, Mamphogoro Tshifhiwa Paris

机构信息

Gastro-Intestinal Microbiology and Biotechnology Unit, Agricultural Research Council-Animal Production, Irene, Pretoria, South Africa, Irene, Gauteng, South Africa.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2025 Jul 10;14(7):e0082324. doi: 10.1128/mra.00823-24. Epub 2025 May 30.

Abstract

is a lactic acid bacterium with several probiotic properties. Here, we present the draft genome sequence of isolated from the porcine ileum with a genome size of 2.1 Mb. The average genome sequence had a G + C content of 43.71% with 113 contigs, 54 RNA, and 2,012 protein-coding sequences.

摘要

是一种具有多种益生菌特性的乳酸菌。在此,我们展示了从猪回肠分离出的基因组草图序列,其基因组大小为2.1 Mb。平均基因组序列的G + C含量为43.71%,有113个重叠群、54个RNA和2012个蛋白质编码序列。

相似文献

6
Draft genome sequence of isolated from human breast milk.从人母乳中分离出的[具体名称未给出]的基因组序列草图。
Microbiol Resour Announc. 2023 Sep 19;12(9):e0112822. doi: 10.1128/MRA.01128-22. Epub 2023 Aug 9.

本文引用的文献

1
Draft genome sequence of isolated from human breast milk.从人母乳中分离出的[具体名称未给出]的基因组序列草图。
Microbiol Resour Announc. 2023 Sep 19;12(9):e0112822. doi: 10.1128/MRA.01128-22. Epub 2023 Aug 9.
7
Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data.Trimmomatic:一款适用于 Illumina 测序数据的灵活修剪工具。
Bioinformatics. 2014 Aug 1;30(15):2114-20. doi: 10.1093/bioinformatics/btu170. Epub 2014 Apr 1.
9
QUAST: quality assessment tool for genome assemblies.QUAST:基因组组装质量评估工具。
Bioinformatics. 2013 Apr 15;29(8):1072-5. doi: 10.1093/bioinformatics/btt086. Epub 2013 Feb 19.
10
Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler transform.使用Burrows-Wheeler变换进行快速准确的短读比对。
Bioinformatics. 2009 Jul 15;25(14):1754-60. doi: 10.1093/bioinformatics/btp324. Epub 2009 May 18.

文献AI研究员

20分钟写一篇综述,助力文献阅读效率提升50倍。

立即体验

用中文搜PubMed

大模型驱动的PubMed中文搜索引擎

马上搜索

文档翻译

学术文献翻译模型,支持多种主流文档格式。

立即体验