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5337,一种具有独特基因组特征的海鞘肠道海洋细菌共生体。

5337, a marine bacterial symbiont of the ascidian gut with unusual genome features.

作者信息

Young Morgan, Natarajan Ojas, Lim Shen Jean, Dishaw Larry J

机构信息

Morsani College of Medicine, Department of Pediatrics, Children's Research Institute, University of South Florida, St. Petersburg, Florida, USA.

College of Marine Science, University of South Florida - St Petersburg Campus, St. Petersburg, Florida, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2025 Sep 11;14(9):e0059425. doi: 10.1128/mra.00594-25. Epub 2025 Jul 31.

DOI:10.1128/mra.00594-25
PMID:40741744
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12424307/
Abstract

We isolated strain 5337, a gut bacterium of the ascidian from Mission Bay, San Diego. The genomic assembly is 6.94 Mb and 99.99% complete, comprising 22 contigs and 6,613 protein-coding genes. Unicycler identified seven circular contigs, and PHASTEST identified 11 prophage regions, including two gene transfer agents.

摘要

我们从圣地亚哥使命湾的海鞘肠道中分离出菌株5337。基因组组装大小为6.94 Mb,完整性为99.99%,由22个重叠群和6613个蛋白质编码基因组成。Unicycler鉴定出7个环状重叠群,PHASTEST鉴定出11个前噬菌体区域,包括两个基因转移因子。

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