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旋转不变性对于在空间转录组学中准确检测空间可变基因至关重要。

Rotation-invariance is essential for accurate detection of spatially variable genes in spatial transcriptomics.

作者信息

Su Haohao, Cui Yuehua

机构信息

Department of Statistics and Probability, Michigan State University, East Lansing, MI, USA.

出版信息

Nat Commun. 2025 Aug 2;16(1):7122. doi: 10.1038/s41467-025-62574-4.

DOI:10.1038/s41467-025-62574-4
PMID:40753081
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12318016/
Abstract

In spatial transcriptomics, tissue samples are randomly positioned. Rotation-sensitive methods can lead to unreliable spatially variable gene (SVG) detection. We highlight their inherent technical pitfalls and discuss strategies for rotation-invariant methods, enhancing the robustness of SVG detection.

摘要

在空间转录组学中,组织样本是随机放置的。对旋转敏感的方法可能导致不可靠的空间可变基因(SVG)检测。我们强调了它们固有的技术缺陷,并讨论了旋转不变方法的策略,以增强SVG检测的稳健性。

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