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斑马鱼(Hamilton,1822年)(鲤形目:鲤科)的基因组序列。

The genome sequence of the zebra danio, (Hamilton, 1822) (Cypriniformes: Danionidae).

作者信息

Howe Kerstin, Howard Caroline, McCarthy Shane A, Wood Jonathan M D

机构信息

Wellcome Sanger Institute, Hinxton, England, UK.

出版信息

Wellcome Open Res. 2025 Jul 4;10:330. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24569.1. eCollection 2025.

Abstract

We present a genome assembly from a specimen of (zebra danio; Chordata; Actinopteri; Cypriniformes; Danionidae). The genome sequence has a total length of 1 413.66 megabases. Most of the assembly (99.85%) is scaffolded into 25 chromosomal pseudomolecules. The mitochondrial genome was also assembled, with a length of 16.6 kilobases. Gene annotation of this assembly on Ensembl identified 25 582 protein-coding genes.

摘要

我们展示了来自(斑马鱼;脊索动物门;辐鳍鱼纲;鲤形目;鲤科)一个样本的基因组组装。基因组序列全长1413.66兆碱基。大部分组装序列(99.85%)被构建成25条染色体假分子。线粒体基因组也被组装出来,长度为16.6千碱基。在Ensembl上对该组装序列进行的基因注释鉴定出25582个蛋白质编码基因。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/919b/12405855/fd10427c9bdd/wellcomeopenres-10-27078-g0000.jpg

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