• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

大脑中动脉还有更多要说的。

MCA has more to say.

作者信息

Hatzimanikatis V, Bailey J E

机构信息

Institute of Biotechnology, ETH-Zurich, Switzerland.

出版信息

J Theor Biol. 1996 Oct 7;182(3):233-42. doi: 10.1006/jtbi.1996.0160.

DOI:10.1006/jtbi.1996.0160
PMID:8944154
Abstract

The recent development of two mathematical frameworks for the analysis and design of metabolic systems is reviewed here. Both frameworks employ a (log)linear kinetic metabolic model that is constructed making direct, explicit use of the individual enzyme kinetic parameters which are a foundation of Metabolic Control Analysis (MCA) information. The first framework allows the description of the dynamic responses of metabolic systems subject to fluctuations in their parameters. The second framework considers the problem of optimizing the regulatory structure of metabolic networks. Both frameworks are powerful in enabling greater insights into metabolism based on MCA quantities.

摘要

本文综述了用于代谢系统分析与设计的两种数学框架的最新进展。这两种框架均采用(对数)线性动力学代谢模型,该模型直接、明确地利用了作为代谢控制分析(MCA)信息基础的各个酶动力学参数来构建。第一个框架允许描述代谢系统在其参数波动时的动态响应。第二个框架考虑了优化代谢网络调控结构的问题。基于MCA量,这两种框架都能有力地帮助人们更深入地了解代谢。

相似文献

1
MCA has more to say.大脑中动脉还有更多要说的。
J Theor Biol. 1996 Oct 7;182(3):233-42. doi: 10.1006/jtbi.1996.0160.
2
Computational approaches to the topology, stability and dynamics of metabolic networks.代谢网络的拓扑结构、稳定性和动力学的计算方法。
Phytochemistry. 2007 Aug-Sep;68(16-18):2139-51. doi: 10.1016/j.phytochem.2007.04.041. Epub 2007 Jun 14.
3
Effects of spatiotemporal variations on metabolic control: approximate analysis using (log)linear kinetic models.时空变化对代谢控制的影响:使用(对数)线性动力学模型的近似分析
Biotechnol Bioeng. 1997 Apr 20;54(2):91-104. doi: 10.1002/(SICI)1097-0290(19970420)54:2<91::AID-BIT1>3.0.CO;2-Q.
4
Time-dependent control of metabolic systems by external effectors.外部效应物对代谢系统的时间依赖性控制。
J Theor Biol. 1996 Oct 7;182(3):341-50. doi: 10.1006/jtbi.1996.0173.
5
Metabolic control analysis of inhibitory feedback interaction: application to biotechnological processes.抑制性反馈相互作用的代谢控制分析:在生物技术过程中的应用。
J Theor Biol. 1996 Oct 7;182(3):405-10. doi: 10.1006/jtbi.1996.0180.
6
A data integration approach for cell cycle analysis oriented to model simulation in systems biology.一种面向系统生物学中模型模拟的细胞周期分析的数据集成方法。
BMC Syst Biol. 2007 Aug 1;1:35. doi: 10.1186/1752-0509-1-35.
7
How constrained is metabolic control?代谢控制受到多大程度的限制?
J Theor Biol. 1996 Oct 7;182(3):277-83. doi: 10.1006/jtbi.1996.0165.
8
The fusion of control analysis and temporal analysis of metabolic systems.代谢系统的控制分析与时间分析的融合。
J Theor Biol. 1996 Oct 7;182(3):327-31. doi: 10.1006/jtbi.1996.0171.
9
Control analysis of unbranched enzymatic chains in states of maximal activity.最大活性状态下无分支酶链的对照分析。
J Theor Biol. 1996 Oct 7;182(3):243-52. doi: 10.1006/jtbi.1996.0161.
10
Control analysis in terms of generalized variables characterizing metabolic systems.基于表征代谢系统的广义变量的控制分析。
J Theor Biol. 1996 Oct 7;182(3):259-68. doi: 10.1006/jtbi.1996.0163.

引用本文的文献

1
Rational strain design with minimal phenotype perturbation.理性的菌株设计,最小化表型干扰。
Nat Commun. 2024 Jan 24;15(1):723. doi: 10.1038/s41467-024-44831-0.
2
Integrating systemic and molecular levels to infer key drivers sustaining metabolic adaptations.整合系统和分子水平,推断维持代谢适应的关键驱动因素。
PLoS Comput Biol. 2021 Jul 23;17(7):e1009234. doi: 10.1371/journal.pcbi.1009234. eCollection 2021 Jul.
3
The effects of model complexity and size on metabolic flux distribution and control: case study in Escherichia coli.
模型复杂度和大小对代谢通量分布和控制的影响:以大肠杆菌为例。
BMC Bioinformatics. 2021 Mar 20;22(1):134. doi: 10.1186/s12859-021-04066-y.
4
Large-scale kinetic metabolic models of KT2440 for consistent design of metabolic engineering strategies.用于代谢工程策略一致性设计的KT2440大规模动力学代谢模型。
Biotechnol Biofuels. 2020 Feb 28;13:33. doi: 10.1186/s13068-020-1665-7. eCollection 2020.
5
Uncertainty reduction in biochemical kinetic models: Enforcing desired model properties.生化动力学模型中的不确定性减少:强制实施所需的模型属性。
PLoS Comput Biol. 2019 Aug 20;15(8):e1007242. doi: 10.1371/journal.pcbi.1007242. eCollection 2019 Aug.
6
Mathematical Modeling and Dynamic Simulation of Metabolic Reaction Systems Using Metabolome Time Series Data.基于代谢组时间序列数据的代谢反应系统的数学建模和动态模拟。
Front Mol Biosci. 2016 May 3;3:15. doi: 10.3389/fmolb.2016.00015. eCollection 2016.
7
Mapping behavioral specifications to model parameters in synthetic biology.将行为规范映射到合成生物学中的模型参数。
BMC Bioinformatics. 2013;14 Suppl 10(Suppl 10):S9. doi: 10.1186/1471-2105-14-S10-S9. Epub 2013 Aug 12.
8
Bridging the gap between gene expression and metabolic phenotype via kinetic models.通过动力学模型弥合基因表达与代谢表型之间的差距。
BMC Syst Biol. 2013 Jul 22;7:63. doi: 10.1186/1752-0509-7-63.
9
Estimation of dynamic flux profiles from metabolic time series data.从代谢时间序列数据估计动态通量分布。
BMC Syst Biol. 2012 Jul 9;6:84. doi: 10.1186/1752-0509-6-84.
10
Analysis of operating principles with S-system models.S 系统模型的运行原理分析。
Math Biosci. 2011 May;231(1):49-60. doi: 10.1016/j.mbs.2011.03.001. Epub 2011 Mar 4.