• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

来自具有地理结构的种群的DNA序列样本中的分离位点数量。

The number of segregating sites in a sample of DNA sequences from a geographically structured population.

作者信息

Notohara M

机构信息

Department of Biology, Faculty of Science, Kyushu University, Fukuoka, Japan.

出版信息

J Math Biol. 1997 Dec;36(2):188-200. doi: 10.1007/s002850050097.

DOI:10.1007/s002850050097
PMID:9440307
Abstract

The distribution of the number of segregating sites among randomly sampled DNA sequences from a geographically structured population is studied. We assume the infinitely-many-sites model of neutral genes and no recombination. Employing the genealogical process, we derive an equation for the generating function of the distribution of the number of segregating sites. First we study the strong-migration limit and prove that the distribution converges to that for a panmictic population. We also study the case of two sampled DNA sequences in the d-dimensional torus model with homogeneous migration.

摘要

我们研究了从一个地理结构群体中随机抽样的DNA序列中分离位点数量的分布。我们假设中性基因的无限多位点模型且无重组。利用谱系过程,我们推导出了分离位点数量分布的生成函数的一个方程。首先,我们研究强迁移极限并证明该分布收敛于随机交配群体的分布。我们还研究了具有均匀迁移的d维环面模型中两个抽样DNA序列的情况。

相似文献

1
The number of segregating sites in a sample of DNA sequences from a geographically structured population.来自具有地理结构的种群的DNA序列样本中的分离位点数量。
J Math Biol. 1997 Dec;36(2):188-200. doi: 10.1007/s002850050097.
2
The coalescent and the genealogical process in geographically structured population.地理结构种群中的溯祖过程与谱系过程。
J Math Biol. 1990;29(1):59-75. doi: 10.1007/BF00173909.
3
Unrooted genealogical tree probabilities in the infinitely-many-sites model.无限多位点模型中的无根系谱树概率。
Math Biosci. 1995 May;127(1):77-98. doi: 10.1016/0025-5564(94)00044-z.
4
DNA polymorphism in a subdivided population: the expected number of segregating sites in the two-subpopulation model.细分群体中的DNA多态性:两亚群模型中分离位点的期望数量
Genetics. 1989 Sep;123(1):229-40. doi: 10.1093/genetics/123.1.229.
5
On the divergence of alleles in nested subsamples from finite populations.关于有限群体中嵌套子样本中等位基因的差异。
Genetics. 1986 Aug;113(4):1057-76. doi: 10.1093/genetics/113.4.1057.
6
Genealogy of neutral genes and spreading of selected mutations in a geographically structured population.地理结构种群中中性基因的谱系与选择突变的传播
Genetics. 1991 Oct;129(2):585-95. doi: 10.1093/genetics/129.2.585.
7
The coalescent process in models with selection.具有选择作用的模型中的溯祖过程。
Genetics. 1988 Nov;120(3):819-29. doi: 10.1093/genetics/120.3.819.
8
The coalescence time of sampled genes in the structured coalescent model.结构化合并模型中采样基因的合并时间。
Theor Popul Biol. 2006 Nov;70(3):289-99. doi: 10.1016/j.tpb.2006.05.005. Epub 2006 May 26.
9
Statistical analysis of DNA polymorphism.DNA多态性的统计分析
Jpn J Genet. 1993 Dec;68(6):567-95. doi: 10.1266/jjg.68.567.
10
The strong-migration limit in geographically structured populations.地理结构种群中的强迁移极限
J Math Biol. 1980 Apr;9(2):101-14. doi: 10.1007/BF00275916.

引用本文的文献

1
On the Recombination Rate Estimation in the Presence of Population Substructure.关于存在群体亚结构时的重组率估计
PLoS One. 2015 Dec 30;10(12):e0145152. doi: 10.1371/journal.pone.0145152. eCollection 2015.
2
Allelic diversity and its implications for the rate of adaptation.等位基因多样性及其对适应速度的影响。
Genetics. 2013 Dec;195(4):1373-84. doi: 10.1534/genetics.113.158410. Epub 2013 Oct 11.
3
An application of the central limit theorem to coalescence times in the structured coalescent model with strong migration.
中心极限定理在具有强迁移的结构化合并模型中对合并时间的应用。
J Math Biol. 2010 Nov;61(5):695-714. doi: 10.1007/s00285-009-0318-z. Epub 2009 Dec 24.
4
Testing comparative phylogeographic models of marine vicariance and dispersal using a hierarchical Bayesian approach.使用分层贝叶斯方法测试海洋生物地理隔离和扩散的比较系统发育地理模型。
BMC Evol Biol. 2008 Nov 27;8:322. doi: 10.1186/1471-2148-8-322.
5
Gene genealogies in a metapopulation.集合种群中的基因谱系。
Genetics. 2001 Oct;159(2):893-905. doi: 10.1093/genetics/159.2.893.
6
The expected number of heterozygous sites in a subdivided population.一个细分群体中杂合位点的预期数量。
Genetics. 1998 Jul;149(3):1599-604. doi: 10.1093/genetics/149.3.1599.