Suppr超能文献

视紫红质发色团模型中的自行车踏板异构化。

Bicycle-pedal isomerization in a rhodopsin chromophore model.

作者信息

Schapiro Igor, Weingart Oliver, Buss Volker

机构信息

Department of Chemistry, University of Duisburg-Essen, 45141 Essen, Germany.

出版信息

J Am Chem Soc. 2009 Jan 14;131(1):16-7. doi: 10.1021/ja805586z.

Abstract

Probing the isomerization of a retinal chromophore model we have found the first ab initio realization of the so-called "bicycle-pedal mechanism". In an ensemble of 47 starting geometries generated by ground-state zero-point-energy sampling one single trajectory followed the aforementioned reaction mode which was proposed by Warshel in 1976. Furthermore restrained optimization of synchronous rotation mode shows that two-double-bond isomerization is barrierless for the conrotatory and disrotatory pathway.

摘要

通过对视网膜发色团模型的异构化进行探究,我们首次从头算实现了所谓的“自行车踏板机制”。在由基态零点能采样生成的47个起始几何构型的集合中,有一条单一轨迹遵循了1976年由沃舍尔提出的上述反应模式。此外,对同步旋转模式的受限优化表明,对于顺旋和对旋途径,双双键异构化是无势垒的。

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