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DnaSP v5:一款用于DNA多态性数据综合分析的软件。

DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data.

作者信息

Librado P, Rozas J

机构信息

Departament de Genètica, Facultat de Biologia and Institut de Recerca de la Biodiversitat, Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain.

出版信息

Bioinformatics. 2009 Jun 1;25(11):1451-2. doi: 10.1093/bioinformatics/btp187. Epub 2009 Apr 3.

DOI:10.1093/bioinformatics/btp187
PMID:19346325
Abstract

MOTIVATION

DnaSP is a software package for a comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Version 5 implements a number of new features and analytical methods allowing extensive DNA polymorphism analyses on large datasets. Among other features, the newly implemented methods allow for: (i) analyses on multiple data files; (ii) haplotype phasing; (iii) analyses on insertion/deletion polymorphism data; (iv) visualizing sliding window results integrated with available genome annotations in the UCSC browser.

AVAILABILITY

Freely available to academic users from: (http://www.ub.edu/dnasp).

摘要

动机

DnaSP是一个用于全面分析DNA多态性数据的软件包。版本5实现了许多新功能和分析方法,允许对大型数据集进行广泛的DNA多态性分析。除其他功能外,新实现的方法还允许:(i)对多个数据文件进行分析;(ii)单倍型定相;(iii)对插入/缺失多态性数据进行分析;(iv)在UCSC浏览器中可视化与可用基因组注释集成的滑动窗口结果。

可用性

学术用户可从以下网址免费获取:(http://www.ub.edu/dnasp)。

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