• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
BioCatalogue: a universal catalogue of web services for the life sciences.生物目录:生命科学领域的通用网络服务目录。
Nucleic Acids Res. 2010 Jul;38(Web Server issue):W689-94. doi: 10.1093/nar/gkq394. Epub 2010 May 19.
2
The EMBRACE web service collection.EMBRACE 网络服务集合。
Nucleic Acids Res. 2010 Jul;38(Web Server issue):W683-8. doi: 10.1093/nar/gkq297. Epub 2010 May 12.
3
MOWServ: a web client for integration of bioinformatic resources.MOWServ:一个用于整合生物信息学资源的网络客户端。
Nucleic Acids Res. 2010 Jul;38(Web Server issue):W671-6. doi: 10.1093/nar/gkq497. Epub 2010 Jun 4.
4
Web service catalogue for Biomedical Grid infrastructure.生物医学网格基础设施的网络服务目录
Stud Health Technol Inform. 2010;159:76-87.
5
IBWS: IST Bioinformatics Web Services.IBWS:IST 生物信息学 Web 服务。
Nucleic Acids Res. 2010 Jul;38(Web Server issue):W712-8. doi: 10.1093/nar/gkq416. Epub 2010 May 19.
6
mORCA: ubiquitous access to life science web services.mORCA:无处不在的生命科学网络服务访问。
BMC Genomics. 2018 Jan 16;19(1):56. doi: 10.1186/s12864-018-4439-x.
7
Biological Web Service Repositories Review.生物网络服务资源库综述
Mol Inform. 2017 May;36(5-6). doi: 10.1002/minf.201600035. Epub 2016 Oct 26.
8
Semi-automatic web service composition for the life sciences using the BioMoby semantic web framework.使用BioMoby语义网框架实现生命科学领域的半自动网络服务组合。
J Biomed Inform. 2008 Oct;41(5):837-47. doi: 10.1016/j.jbi.2008.02.005. Epub 2008 Mar 4.
9
BOWS (bioinformatics open web services) to centralize bioinformatics tools in web services.BOWS(生物信息学开放网络服务)旨在将生物信息学工具集中于网络服务中。
BMC Res Notes. 2015 Jun 2;8:206. doi: 10.1186/s13104-015-1190-0.
10
XMPP for cloud computing in bioinformatics supporting discovery and invocation of asynchronous web services.云计算中的 XMPP 支持生物信息学中的发现和异步 Web 服务的调用。
BMC Bioinformatics. 2009 Sep 4;10:279. doi: 10.1186/1471-2105-10-279.

引用本文的文献

1
Playbook workflow builder: Interactive construction of bioinformatics workflows.剧本工作流程构建器:生物信息学工作流程的交互式构建
PLoS Comput Biol. 2025 Apr 3;21(4):e1012901. doi: 10.1371/journal.pcbi.1012901. eCollection 2025 Apr.
2
SynBioTools: a one-stop facility for searching and selecting synthetic biology tools.SynBioTools:一站式搜索和选择合成生物学工具的平台。
BMC Bioinformatics. 2023 Apr 17;24(1):152. doi: 10.1186/s12859-023-05281-5.
3
Developing and reusing bioinformatics data analysis pipelines using scientific workflow systems.使用科学工作流系统开发和重用生物信息学数据分析管道。
Comput Struct Biotechnol J. 2023 Mar 7;21:2075-2085. doi: 10.1016/j.csbj.2023.03.003. eCollection 2023.
4
Perspectives on automated composition of workflows in the life sciences.生命科学中工作流自动化组合的观点。
F1000Res. 2021 Sep 7;10:897. doi: 10.12688/f1000research.54159.1. eCollection 2021.
5
Expasy, the Swiss Bioinformatics Resource Portal, as designed by its users.瑞士生物信息学资源门户 Expasy,由其用户设计。
Nucleic Acids Res. 2021 Jul 2;49(W1):W216-W227. doi: 10.1093/nar/gkab225.
6
UCSF ChimeraX: Structure visualization for researchers, educators, and developers.UCSF ChimeraX:面向研究人员、教育工作者和开发者的结构可视化工具。
Protein Sci. 2021 Jan;30(1):70-82. doi: 10.1002/pro.3943. Epub 2020 Oct 22.
7
Recognizing software names in biomedical literature using machine learning.使用机器学习识别生物医学文献中的软件名称。
Health Informatics J. 2020 Mar;26(1):21-33. doi: 10.1177/1460458219869490. Epub 2019 Sep 30.
8
U-Index, a dataset and an impact metric for informatics tools and databases.U-Index,一个用于信息学工具和数据库的数据集和影响力指标。
Sci Data. 2018 Mar 20;5:180043. doi: 10.1038/sdata.2018.43.
9
Using bio.tools to generate and annotate workbench tool descriptions.使用生物工具生成并注释工作台工具描述。
F1000Res. 2017 Nov 30;6. doi: 10.12688/f1000research.12974.1. eCollection 2017.
10
Exploring Protein-Protein Interactions as Drug Targets for Anti-cancer Therapy with In Silico Workflows.利用计算机模拟工作流程探索蛋白质-蛋白质相互作用作为抗癌治疗的药物靶点
Methods Mol Biol. 2017;1647:221-236. doi: 10.1007/978-1-4939-7201-2_15.

本文引用的文献

1
Editorial: Nucleic Acids Research annual Web Server Issue in 2015.社论:《核酸研究》2015年年度网络服务器专刊
Nucleic Acids Res. 2015 Jul 1;43(W1):W1-2. doi: 10.1093/nar/gkv581.
2
Fast and efficient searching of biological data resources--using EB-eye.快速高效地搜索生物数据资源——使用 EB-eye。
Brief Bioinform. 2010 Jul;11(4):375-84. doi: 10.1093/bib/bbp065. Epub 2010 Feb 11.
3
The 2010 Nucleic Acids Research Database Issue and online Database Collection: a community of data resources.2010 年核酸研究数据库问题及在线数据库收藏:一个数据资源社区。
Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(Database issue):D1-4. doi: 10.1093/nar/gkp1077. Epub 2009 Dec 3.
4
KEGG for representation and analysis of molecular networks involving diseases and drugs.KEGG 用于表示和分析涉及疾病和药物的分子网络。
Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(Database issue):D355-60. doi: 10.1093/nar/gkp896. Epub 2009 Oct 30.
5
DDBJ launches a new archive database with analytical tools for next-generation sequence data.DDBJ 发布了一个带有下一代测序数据分析工具的新档案数据库。
Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(Database issue):D33-8. doi: 10.1093/nar/gkp847. Epub 2009 Oct 22.
6
SSWAP: A Simple Semantic Web Architecture and Protocol for semantic web services.SSWAP:一种用于语义 Web 服务的简单语义 Web 架构和协议。
BMC Bioinformatics. 2009 Sep 23;10:309. doi: 10.1186/1471-2105-10-309.
7
Evolution in bioinformatic resources: 2009 update on the Bioinformatics Links Directory.生物信息学资源的发展:2009年生物信息学链接目录更新
Nucleic Acids Res. 2009 Jul;37(Web Server issue):W3-5. doi: 10.1093/nar/gkp531. Epub 2009 Jun 15.
8
An active registry for bioinformatics web services.生物信息学网络服务的活动注册中心。
Bioinformatics. 2009 Aug 15;25(16):2090-1. doi: 10.1093/bioinformatics/btp329. Epub 2009 May 21.
9
Web services at the European Bioinformatics Institute-2009.欧洲生物信息学研究所的网络服务-2009年。
Nucleic Acids Res. 2009 Jul;37(Web Server issue):W6-10. doi: 10.1093/nar/gkp302. Epub 2009 May 12.
10
Data curation + process curation=data integration + science.数据管理 + 流程管理 = 数据整合 + 科学。
Brief Bioinform. 2008 Nov;9(6):506-17. doi: 10.1093/bib/bbn034. Epub 2008 Dec 6.

生物目录:生命科学领域的通用网络服务目录。

BioCatalogue: a universal catalogue of web services for the life sciences.

机构信息

School of Computer Science, The University of Manchester, Manchester, M13 9PL, UK.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2010 Jul;38(Web Server issue):W689-94. doi: 10.1093/nar/gkq394. Epub 2010 May 19.

DOI:10.1093/nar/gkq394
PMID:20484378
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2896129/
Abstract

The use of Web Services to enable programmatic access to on-line bioinformatics is becoming increasingly important in the Life Sciences. However, their number, distribution and the variable quality of their documentation can make their discovery and subsequent use difficult. A Web Services registry with information on available services will help to bring together service providers and their users. The BioCatalogue (http://www.biocatalogue.org/) provides a common interface for registering, browsing and annotating Web Services to the Life Science community. Services in the BioCatalogue can be described and searched in multiple ways based upon their technical types, bioinformatics categories, user tags, service providers or data inputs and outputs. They are also subject to constant monitoring, allowing the identification of service problems and changes and the filtering-out of unavailable or unreliable resources. The system is accessible via a human-readable 'Web 2.0'-style interface and a programmatic Web Service interface. The BioCatalogue follows a community approach in which all services can be registered, browsed and incrementally documented with annotations by any member of the scientific community.

摘要

在生命科学领域,使用 Web 服务来实现对在线生物信息学的编程访问变得越来越重要。然而,它们的数量、分布以及文档质量的参差不齐使得发现和后续使用变得困难。一个包含可用服务信息的 Web 服务注册中心将有助于将服务提供商及其用户聚集在一起。BioCatalogue(http://www.biocatalogue.org/)为生命科学界提供了一个用于注册、浏览和注释 Web 服务的通用接口。BioCatalogue 中的服务可以根据其技术类型、生物信息学类别、用户标签、服务提供商或数据输入和输出以多种方式进行描述和搜索。它们还受到持续监控,允许识别服务问题和更改,并过滤掉不可用或不可靠的资源。该系统可通过人类可读的“Web 2.0”风格的界面和编程 Web 服务接口进行访问。BioCatalogue 采用社区方法,任何科学界成员都可以注册、浏览和使用注释来逐步记录所有服务。