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Genevar:一个数据库和 Java 应用程序,用于分析和可视化 eQTL 研究中 SNP-基因关联。

Genevar: a database and Java application for the analysis and visualization of SNP-gene associations in eQTL studies.

机构信息

Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1HH, UK.

出版信息

Bioinformatics. 2010 Oct 1;26(19):2474-6. doi: 10.1093/bioinformatics/btq452. Epub 2010 Aug 10.

DOI:10.1093/bioinformatics/btq452
PMID:20702402
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2944204/
Abstract

UNLABELLED

Genevar (GENe Expression VARiation) is a database and Java tool designed to integrate multiple datasets, and provides analysis and visualization of associations between sequence variation and gene expression. Genevar allows researchers to investigate expression quantitative trait loci (eQTL) associations within a gene locus of interest in real time. The database and application can be installed on a standard computer in database mode and, in addition, on a server to share discoveries among affiliations or the broader community over the Internet via web services protocols.

AVAILABILITY

http://www.sanger.ac.uk/resources/software/genevar.

摘要

未标注

Genevar(GENe Expression VARiation)是一个数据库和 Java 工具,旨在整合多个数据集,并提供序列变异与基因表达之间关联的分析和可视化。Genevar 允许研究人员实时研究感兴趣基因座内的表达数量性状基因座(eQTL)关联。该数据库和应用程序可以在数据库模式下安装在标准计算机上,此外,还可以安装在服务器上,通过 Web 服务协议在互联网上在关联或更广泛的社区中共享发现。

可用性

http://www.sanger.ac.uk/resources/software/genevar。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7d6f/2944204/507a84beffe6/btq452f1.jpg
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