Suppr超能文献

氟化蛋白表面的水动力学。

Hydration dynamics at fluorinated protein surfaces.

机构信息

Division of Chemistry and Chemical Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, CA 91125, USA.

出版信息

Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Oct 5;107(40):17101-6. doi: 10.1073/pnas.1011569107. Epub 2010 Sep 20.

Abstract

Water-protein interactions dictate many processes crucial to protein function including folding, dynamics, interactions with other biomolecules, and enzymatic catalysis. Here we examine the effect of surface fluorination on water-protein interactions. Modification of designed coiled-coil proteins by incorporation of 5,5,5-trifluoroleucine or (4S)-2-amino-4-methylhexanoic acid enables systematic examination of the effects of side-chain volume and fluorination on solvation dynamics. Using ultrafast fluorescence spectroscopy, we find that fluorinated side chains exert electrostatic drag on neighboring water molecules, slowing water motion at the protein surface.

摘要

水-蛋白质相互作用决定了许多对蛋白质功能至关重要的过程,包括折叠、动力学、与其他生物分子的相互作用以及酶催化。在这里,我们研究了表面氟化对水-蛋白质相互作用的影响。通过在设计的螺旋蛋白中掺入 5,5,5-三氟亮氨酸或(4S)-2-氨基-4-甲基己酸来修饰,可以系统地研究侧链体积和氟化对溶剂化动力学的影响。使用超快荧光光谱法,我们发现氟化侧链对相邻水分子施加静电力拖曳,从而减慢蛋白质表面的水分子运动。

相似文献

1
Hydration dynamics at fluorinated protein surfaces.氟化蛋白表面的水动力学。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Oct 5;107(40):17101-6. doi: 10.1073/pnas.1011569107. Epub 2010 Sep 20.
4
Dynamics and mechanism of ultrafast water-protein interactions.超快水-蛋白质相互作用的动力学与机制
Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Jul 26;113(30):8424-9. doi: 10.1073/pnas.1602916113. Epub 2016 Jun 23.
6
Fluorine: a new element in protein design.氟:蛋白质设计的新元素。
Protein Sci. 2012 Apr;21(4):453-62. doi: 10.1002/pro.2030. Epub 2012 Feb 14.
9
Influence of fluorination on the thermodynamics of protein folding.氟原子取代对蛋白质折叠热力学的影响。
J Am Chem Soc. 2012 Aug 8;134(31):13027-34. doi: 10.1021/ja303521h. Epub 2012 Jul 30.

引用本文的文献

2
Fluorinated Protein-Ligand Complexes: A Computational Perspective.氟化蛋白-配体复合物:计算视角。
J Phys Chem B. 2024 Jun 27;128(25):5925-5934. doi: 10.1021/acs.jpcb.4c01493. Epub 2024 Jun 17.
10
An ultrahigh affinity d-peptide antagonist Of MDM2.一种超高亲和力的 d-肽 MDM2 拮抗剂。
J Med Chem. 2012 Jul 12;55(13):6237-41. doi: 10.1021/jm3005465. Epub 2012 Jun 22.

本文引用的文献

2
Molecular origins of fluorocarbon hydrophobicity.氟碳化合物疏水性的分子起源。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Aug 3;107(31):13603-7. doi: 10.1073/pnas.0915169107. Epub 2010 Jul 19.
9
Fluorine in pharmaceuticals: looking beyond intuition.药物中的氟:超越直觉的探索。
Science. 2007 Sep 28;317(5846):1881-6. doi: 10.1126/science.1131943.

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验