乳杆菌科 coryniformis 亚种 coryniformis KCTC 3167 的基因组序列。
Genome sequence of Lactobacillus coryniformis subsp. coryniformis KCTC 3167.
机构信息
Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, Yuseong-gu, Daejeon 305-806, Republic of Korea.
出版信息
J Bacteriol. 2011 Feb;193(4):1014-5. doi: 10.1128/JB.01394-10. Epub 2010 Dec 10.
Abstract
Lactobacillus coryniformis subsp. coryniformis is known to be present during the manufacturing process of kimchi, the best-known traditional Korean dish. Here, we present the draft genome sequence of Lactobacillus coryniformis subsp. coryniformis type strain KCTC 3167 (2,964,752 bp, with a G+C content of 42.8%), which consists of 55 scaffolds.
摘要
乳杆菌科棒状亚种是在制作韩国传统菜肴泡菜的过程中被发现的。在此，我们呈现乳杆菌科棒状亚种模式菌株 KCTC 3167 的草图基因组序列（2964752bp，GC 含量为 42.8%），它由 55 个支架组成。
相似文献
1
Genome sequence of Lactobacillus coryniformis subsp. coryniformis KCTC 3167.乳杆菌科 coryniformis 亚种 coryniformis KCTC 3167 的基因组序列。
J Bacteriol. 2011 Feb;193(4):1014-5. doi: 10.1128/JB.01394-10. Epub 2010 Dec 10.
2
Genome sequence of Lactobacillus animalis KCTC 3501.动物乳杆菌 KCTC 3501 的基因组序列。
J Bacteriol. 2011 Mar;193(5):1280-1. doi: 10.1128/JB.01505-10. Epub 2010 Dec 23.
3
Genome sequence of Lactobacillus farciminis KCTC 3681.法氏乳杆菌 KCTC 3681 的基因组序列。
J Bacteriol. 2011 Apr;193(7):1790-1. doi: 10.1128/JB.00003-11. Epub 2011 Jan 21.
4
Genome sequence of Leuconostoc argentinum KCTC 3773.阿根廷乳球菌 KCTC 3773 的基因组序列。
J Bacteriol. 2010 Dec;192(24):6490-1. doi: 10.1128/JB.01148-10. Epub 2010 Oct 15.
5
Genome sequence of Lactobacillus fructivorans KCTC 3543.植物乳杆菌 KCTC 3543 的基因组序列。
J Bacteriol. 2012 Apr;194(8):2111-2. doi: 10.1128/JB.00075-12.
6
Draft genome sequence of Lactobacillus mali KCTC 3596.Lactobacillus mali KCTC 3596 基因组草图
J Bacteriol. 2011 Sep;193(18):5037. doi: 10.1128/JB.05686-11. Epub 2011 Jul 8.
7
Genome sequence of Leuconostoc fallax KCTC 3537.副干酪乳杆菌 KCTC 3537 的基因组序列。
J Bacteriol. 2011 Jan;193(2):588-9. doi: 10.1128/JB.01300-10. Epub 2010 Nov 12.
8
Draft genome sequence of Lactobacillus zeae KCTC 3804.解淀粉乳杆菌 KCTC 3804 基因组草图
J Bacteriol. 2011 Sep;193(18):5023. doi: 10.1128/JB.05602-11.
9
Draft genome sequence of Lactobacillus malefermentans KCTC 3548.乳杆菌 malefermentans KCTC 3548 基因组草图。
J Bacteriol. 2011 Oct;193(19):5537. doi: 10.1128/JB.05710-11.
10
Genome sequence of the bacteriocin-producing Lactobacillus curvatus strain CRL705.产细菌素乳杆菌 CRL705 的基因组序列。
J Bacteriol. 2012 Jan;194(2):538-9. doi: 10.1128/JB.06416-11.
本文引用的文献
1
The Genomes On Line Database (GOLD) in 2009: status of genomic and metagenomic projects and their associated metadata.《基因组在线数据库（GOLD）》2009 年报告：基因组和宏基因组项目及其相关元数据的现状。
Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(Database issue):D346-54. doi: 10.1093/nar/gkp848. Epub 2009 Nov 13.
2
The RAST Server: rapid annotations using subsystems technology.RAST服务器：使用子系统技术进行快速注释。
BMC Genomics. 2008 Feb 8;9:75. doi: 10.1186/1471-2164-9-75.
3
RNAmmer: consistent and rapid annotation of ribosomal RNA genes.RNAmmer：核糖体RNA基因的一致性快速注释
Nucleic Acids Res. 2007;35(9):3100-8. doi: 10.1093/nar/gkm160. Epub 2007 Apr 22.
4
Identifying bacterial genes and endosymbiont DNA with Glimmer.使用Glimmer识别细菌基因和内共生体DNA。
Bioinformatics. 2007 Mar 15;23(6):673-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btm009. Epub 2007 Jan 19.
5
Development and evaluation of genome-probing microarrays for monitoring lactic acid bacteria.用于监测乳酸菌的基因组探测微阵列的开发与评估
Appl Environ Microbiol. 2005 Dec;71(12):8825-35. doi: 10.1128/AEM.71.12.8825-8835.2005.
6
Daily intake assessment of saccharin, stevioside, D-sorbitol and aspartame from various processed foods in Korea.韩国各类加工食品中糖精、甜菊糖苷、D-山梨醇和阿斯巴甜的每日摄入量评估。
Food Addit Contam. 2005 Nov;22(11):1087-97. doi: 10.1080/02652030500202092.
7
The Universal Protein Resource (UniProt).通用蛋白质资源（UniProt）。
Nucleic Acids Res. 2005 Jan 1;33(Database issue):D154-9. doi: 10.1093/nar/gki070.
8
The KEGG resource for deciphering the genome.用于解读基因组的KEGG资源。
Nucleic Acids Res. 2004 Jan 1;32(Database issue):D277-80. doi: 10.1093/nar/gkh063.
9
The COG database: an updated version includes eukaryotes.COG数据库：更新版本涵盖真核生物。
BMC Bioinformatics. 2003 Sep 11;4:41. doi: 10.1186/1471-2105-4-41.
10
tRNAscan-SE: a program for improved detection of transfer RNA genes in genomic sequence.tRNAscan-SE：用于改进基因组序列中转运RNA基因检测的程序。
Nucleic Acids Res. 1997 Mar 1;25(5):955-64. doi: 10.1093/nar/25.5.955.
Zotero 插件