Suppr超能文献

药物发现中分子动力学模拟的未来。

The future of molecular dynamics simulations in drug discovery.

机构信息

D. E. Shaw Research, New York, NY 10036, USA.

出版信息

J Comput Aided Mol Des. 2012 Jan;26(1):15-26. doi: 10.1007/s10822-011-9517-y. Epub 2011 Dec 20.

Abstract

Molecular dynamics simulations can now track rapid processes--those occurring in less than about a millisecond--at atomic resolution for many biologically relevant systems. These simulations appear poised to exert a significant impact on how new drugs are found, perhaps even transforming the very process of drug discovery. We predict here future results we can expect from, and enhancements we need to make in, molecular dynamics simulations over the coming 25 years, and in so doing set out several Grand Challenges for the field. In the context of the problems now facing the pharmaceutical industry, we ask how we can best address drug discovery needs of the next quarter century using molecular dynamics simulations, and we suggest some possible approaches.

摘要

分子动力学模拟现在可以在原子分辨率下追踪许多与生物学相关的系统中发生的快速过程——那些在大约一毫秒内发生的过程。这些模拟似乎准备对新药的发现产生重大影响,甚至可能改变药物发现的过程。在这里,我们预测了在未来 25 年内,分子动力学模拟可以产生的未来结果,以及我们需要在哪些方面进行改进,并为该领域设定了几个重大挑战。在当前制药行业面临的问题的背景下,我们询问如何最好地使用分子动力学模拟来满足未来四分之一个世纪的药物发现需求,并提出了一些可能的方法。

相似文献

1
The future of molecular dynamics simulations in drug discovery.药物发现中分子动力学模拟的未来。
J Comput Aided Mol Des. 2012 Jan;26(1):15-26. doi: 10.1007/s10822-011-9517-y. Epub 2011 Dec 20.
2
Fragment-based lead discovery: challenges and opportunities.基于片段的先导化合物发现:挑战与机遇。
J Comput Aided Mol Des. 2011 Jul;25(7):607-10. doi: 10.1007/s10822-011-9451-z. Epub 2011 Jul 6.
6
Computational chemistry in 25 years.25 年内的计算化学。
J Comput Aided Mol Des. 2012 Jan;26(1):9-10. doi: 10.1007/s10822-011-9516-z. Epub 2011 Dec 13.
8

引用本文的文献

本文引用的文献

1
Compound Design by Fragment-Linking.碎片连接的化合物设计。
Mol Inform. 2011 Apr 18;30(4):298-306. doi: 10.1002/minf.201000174. Epub 2011 Apr 6.
4
Lessons from 54 years of pharmaceutical research.54年药物研究的经验教训。
Nat Rev Drug Discov. 2011 Oct 31;10(12):963. doi: 10.1038/nrd2961-c1.
6
How fast-folding proteins fold.快速折叠蛋白如何折叠。
Science. 2011 Oct 28;334(6055):517-20. doi: 10.1126/science.1208351.
7
An assessment of R&D productivity in the pharmaceutical industry.制药行业研发生产力评估。
Trends Pharmacol Sci. 2011 Dec;32(12):683-5. doi: 10.1016/j.tips.2011.09.005. Epub 2011 Oct 24.
10
Getting physical to fix pharma.动起来,让制药业重焕生机。
Nat Chem. 2011 Aug 23;3(9):692-5. doi: 10.1038/nchem.1121.

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验