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斯坦利氏海洋杆菌 S30 菌株的基因组草图，该菌株分离自密克罗尼西亚楚克州的一个沿海泻湖。

Draft genome sequence of Marinobacterium stanieri S30, a strain isolated from a coastal lagoon in Chuuk state in Micronesia.

机构信息

Korea Ocean Research & Development Institute, Ansan, Republic of Korea.

出版信息

J Bacteriol. 2012 Mar;194(5):1260. doi: 10.1128/JB.06703-11.

DOI:10.1128/JB.06703-11
PMID:22328757
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3294781/
Abstract

In this study, we isolated xylan-degrading bacteria from a coastal lagoon of Micronesia and identified the bacteria as Marinobacterium stanieri S30. GSFLX 454 pyrosequencing and sequence analysis of the M. stanieri S30 genome generated 4,007 predicted open reading frames (ORFs) that could be candidate genes for producing enzymes with different catalytic functions.

摘要

在这项研究中，我们从密克罗尼西亚的一个沿海泻湖分离出了木聚糖降解细菌，并将该细菌鉴定为斯坦利氏海洋杆菌 S30。GSFLX 454 焦磷酸测序和斯坦利氏海洋杆菌 S30 基因组的序列分析产生了 4007 个预测的开放阅读框（ORFs），这些 ORFs 可能是产生具有不同催化功能的酶的候选基因。