• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
σ70 and PhoB activator: getting a better grip.σ70和PhoB激活因子:更好地掌控
Transcription. 2012 Jul-Aug;3(4):160-4. doi: 10.4161/trns.20444. Epub 2012 Jul 1.
2
The structure of a transcription activation subcomplex reveals how σ(70) is recruited to PhoB promoters.转录激活亚基复合物的结构揭示了 σ(70) 如何被招募到 PhoB 启动子上。
EMBO J. 2011 Aug 9;30(18):3776-85. doi: 10.1038/emboj.2011.271.
3
The Escherichia coli Ada protein can interact with two distinct determinants in the sigma70 subunit of RNA polymerase according to promoter architecture: identification of the target of Ada activation at the alkA promoter.根据启动子结构,大肠杆菌Ada蛋白可与RNA聚合酶σ70亚基中的两个不同决定簇相互作用:alkA启动子处Ada激活靶点的鉴定。
J Bacteriol. 1999 Mar;181(5):1524-9. doi: 10.1128/JB.181.5.1524-1529.1999.
4
Interaction of Escherichia coli RNA polymerase σ70 subunit with promoter elements in the context of free σ70, RNA polymerase holoenzyme, and the β'-σ70 complex.大肠杆菌 RNA 聚合酶 σ70 亚基与启动子元件在游离 σ70、RNA 聚合酶全酶和 β'-σ70 复合物中的相互作用。
J Biol Chem. 2011 Jan 7;286(1):270-9. doi: 10.1074/jbc.M110.174102. Epub 2010 Oct 15.
5
Role of the sigma 70 subunit of RNA polymerase in transcriptional activation by activator protein PhoB in Escherichia coli.RNA聚合酶的σ70亚基在大肠杆菌中激活蛋白PhoB介导的转录激活中的作用。
Genes Dev. 1993 Jan;7(1):149-60. doi: 10.1101/gad.7.1.149.
6
Structural basis for -35 element recognition by σ chimera proteins and their interactions with PmrA response regulator.σ 嵌合体蛋白识别 -35 元件的结构基础及其与 PmrA 应答调节蛋白的相互作用。
Proteins. 2020 Jan;88(1):69-81. doi: 10.1002/prot.25768. Epub 2019 Jul 22.
7
Functional interaction between RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain and sigma70 in UP-element- and activator-dependent transcription.RNA聚合酶α亚基C末端结构域与σ70在UP元件和激活因子依赖性转录中的功能相互作用。
Mol Cell. 2003 Jun;11(6):1621-33. doi: 10.1016/s1097-2765(03)00201-6.
8
The effect of the DNA conformation on the rate of NtrC activated transcription of Escherichia coli RNA polymerase.sigma(54) holoenzyme.DNA构象对大肠杆菌RNA聚合酶σ⁵⁴全酶NtrC激活转录速率的影响。
J Mol Biol. 2000 Jul 21;300(4):709-25. doi: 10.1006/jmbi.2000.3921.
9
Tethering sigma70 to RNA polymerase reveals high in vivo activity of sigma factors and sigma70-dependent pausing at promoter-distal locations.将σ70与RNA聚合酶拴系揭示了σ因子在体内的高活性以及在启动子远端位置的σ70依赖性暂停。
Genes Dev. 2003 Nov 15;17(22):2839-51. doi: 10.1101/gad.1142203.
10
Signaling through sigma.通过σ受体的信号传导。
Nat Struct Biol. 2000 Jul;7(7):530-2. doi: 10.1038/76732.

引用本文的文献

1
Genome-Wide Mapping of the Escherichia coli PhoB Regulon Reveals Many Transcriptionally Inert, Intragenic Binding Sites.全基因组范围内的大肠杆菌 PhoB 调控因子图谱显示了许多转录惰性、基因内结合位点。
mBio. 2023 Jun 27;14(3):e0253522. doi: 10.1128/mbio.02535-22. Epub 2023 Apr 17.
2
Genome-wide mapping of the PhoB regulon reveals many transcriptionally inert, intragenic binding sites.PhoB 调控子的全基因组图谱揭示了许多转录惰性的基因内结合位点。
bioRxiv. 2023 Feb 7:2023.02.07.527549. doi: 10.1101/2023.02.07.527549.
3
Evolution of Regulated Transcription.调控转录的进化。
Cells. 2020 Jul 12;9(7):1675. doi: 10.3390/cells9071675.
4
Control of the Regulon in .……中调节子的控制
EcoSal Plus. 2019 Sep;8(2). doi: 10.1128/ecosalplus.ESP-0006-2019.
5
Genome-wide identification of genes directly regulated by ChvI and a consensus sequence for ChvI binding in Sinorhizobium meliloti.全基因组鉴定受 ChvI 直接调控的基因和 Sinorhizobium meliloti 中 ChvI 结合的一致序列。
Mol Microbiol. 2018 Nov;110(4):596-615. doi: 10.1111/mmi.14119. Epub 2018 Oct 21.

本文引用的文献

1
Structural basis for promoter-10 element recognition by the bacterial RNA polymerase σ subunit.细菌 RNA 聚合酶 σ 亚基识别启动子-10 元件的结构基础。
Cell. 2011 Dec 9;147(6):1257-69. doi: 10.1016/j.cell.2011.10.041. Epub 2011 Dec 1.
2
Crystal structure of the bacteriophage T4 late-transcription coactivator gp33 with the β-subunit flap domain of Escherichia coli RNA polymerase.T4 噬菌体晚期转录共激活因子 gp33 与大肠杆菌 RNA 聚合酶 β 亚基瓣状结构域的晶体结构。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Dec 13;108(50):19961-6. doi: 10.1073/pnas.1113328108. Epub 2011 Dec 1.
3
A novel conformation of RNA polymerase sheds light on the mechanism of transcription.一种新型的RNA聚合酶构象揭示了转录机制。
Transcription. 2011 Jul;2(4):162-167. doi: 10.4161/trns.2.4.16148.
4
The structure of a transcription activation subcomplex reveals how σ(70) is recruited to PhoB promoters.转录激活亚基复合物的结构揭示了 σ(70) 如何被招募到 PhoB 启动子上。
EMBO J. 2011 Aug 9;30(18):3776-85. doi: 10.1038/emboj.2011.271.
5
The X-ray crystal structures of two constitutively active mutants of the Escherichia coli PhoB receiver domain give insights into activation.大肠杆菌PhoB受体结构域两个组成型活性突变体的X射线晶体结构为激活机制提供了见解。
J Mol Biol. 2007 Feb 16;366(2):626-41. doi: 10.1016/j.jmb.2006.11.038. Epub 2006 Nov 14.
6
Multiple regulators control expression of the Entner-Doudoroff aldolase (Eda) of Escherichia coli.多种调控因子控制大肠杆菌的Entner-Doudoroff醛缩酶(Eda)的表达。
J Bacteriol. 2005 Feb;187(3):991-1000. doi: 10.1128/JB.187.3.991-1000.2005.
7
Residues required for Bacillus subtilis PhoP DNA binding or RNA polymerase interaction: alanine scanning of PhoP effector domain transactivation loop and alpha helix 3.枯草芽孢杆菌PhoP DNA结合或RNA聚合酶相互作用所需的残基:PhoP效应结构域反式激活环和α螺旋3的丙氨酸扫描
J Bacteriol. 2004 Mar;186(5):1493-502. doi: 10.1128/JB.186.5.1493-1502.2004.
8
Structure of a ternary transcription activation complex.三元转录激活复合物的结构
Mol Cell. 2004 Jan 16;13(1):45-53. doi: 10.1016/s1097-2765(03)00483-0.
9
Functional interaction between RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain and sigma70 in UP-element- and activator-dependent transcription.RNA聚合酶α亚基C末端结构域与σ70在UP元件和激活因子依赖性转录中的功能相互作用。
Mol Cell. 2003 Jun;11(6):1621-33. doi: 10.1016/s1097-2765(03)00201-6.
10
Bacterial RNA polymerases: the wholo story.细菌RNA聚合酶:完整的故事。
Curr Opin Struct Biol. 2003 Feb;13(1):31-9. doi: 10.1016/s0959-440x(02)00005-2.

σ70和PhoB激活因子:更好地掌控

σ70 and PhoB activator: getting a better grip.

作者信息

Canals Albert, Blanco Alexandre G, Coll Miquel

机构信息

Institute for Research in Biomedicine, Barcelona, Spain.

出版信息

Transcription. 2012 Jul-Aug;3(4):160-4. doi: 10.4161/trns.20444. Epub 2012 Jul 1.

DOI:10.4161/trns.20444
PMID:22771992
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3654763/
Abstract

Transcription factors modulate gene expression by distinct, barely understood mechanisms. The crystal structure of a bacterial transcription subcomplex comprising the effector domain of factor PhoB, its target DNA and the σ4 domain of the RNA polymerase σ70 subunit supports the notion that a stronger grip on the promoter-factor complex results in an enhanced RNAP architecture.

摘要

转录因子通过独特且鲜为人知的机制调节基因表达。一种细菌转录亚复合物的晶体结构,该复合物包含因子PhoB的效应结构域、其靶DNA以及RNA聚合酶σ70亚基的σ4结构域,支持了这样一种观点,即对启动子 - 因子复合物更强的结合会导致RNA聚合酶结构的增强。