• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
Genome Sequence of Marine Bacterium Idiomarina sp. Strain 28-8, Isolated from Korean Ark Shells.从韩国魁蛤中分离出的海洋细菌Idiomarina sp.菌株28-8的基因组序列
Genome Announc. 2013 Oct 3;1(5):e00772-13. doi: 10.1128/genomeA.00772-13.
2
Rhodopirellula rosea sp. nov., a novel bacterium isolated from an ark clam Scapharca broughtonii.玫瑰色红杆菌（Rhodopirellula rosea）sp. 全新种，一种从砗磲 Scapharca broughtonii 中分离得到的新型细菌。
J Microbiol. 2013 Jun;51(3):301-4. doi: 10.1007/s12275-013-3210-x. Epub 2013 Jun 28.
3
Roseovarius scapharcae sp. nov., isolated from ark shell Scapharca broughtonii.新种玫瑰海弧菌，从毛蚶中分离得到。
Int J Syst Evol Microbiol. 2015 Dec;65(12):4695-4700. doi: 10.1099/ijsem.0.000633. Epub 2015 Sep 24.
4
Aliisedimentitalea scapharcae gen. nov., sp. nov., isolated from ark shell Scapharca broughtonii.从魁蚶（Scapharca broughtonii）中分离得到的艾氏沉积菌属（Aliisedimentitalea）新属、新种。
J Microbiol. 2015 Aug;53(8):495-502. doi: 10.1007/s12275-015-5075-7. Epub 2015 Jul 31.
5
Idiomarina maris sp. nov., a marine bacterium isolated from sediment.海洋细菌 Idiomarina maris sp. nov. ，分离自沉积物。
Int J Syst Evol Microbiol. 2012 Feb;62(Pt 2):370-375. doi: 10.1099/ijs.0.027896-0. Epub 2011 Mar 25.
6
Idiomarina salinarum sp. nov., isolated from a marine solar saltern in Korea.盐沼嗜盐菌新种，从韩国的一个海洋太阳能盐场分离得到。
Int J Syst Evol Microbiol. 2007 Nov;57(Pt 11):2503-2506. doi: 10.1099/ijs.0.65189-0.
7
Ruegeria conchae sp. nov., isolated from the ark clam Scapharca broughtonii.贝壳蛤 Ruegeria conchae sp. nov.，分离自引种的大珠母贝 Scapharca broughtonii。
Int J Syst Evol Microbiol. 2012 Dec;62(Pt 12):2851-2857. doi: 10.1099/ijs.0.037283-0. Epub 2012 Jan 6.
8
Comparative analysis of 16S rRNA signature sequences of the genus Idiomarina and Idiomarina woesei sp. nov., a novel marine bacterium isolated from the Andaman Sea.对海洋盐单胞菌属（Idiomarina）和新种沃氏海洋盐单胞菌（Idiomarina woesei sp. nov.）的16S rRNA特征序列的比较分析，沃氏海洋盐单胞菌是从安达曼海分离出的一种新型海洋细菌。
Res Microbiol. 2014 Sep;165(7):501-7. doi: 10.1016/j.resmic.2014.07.008. Epub 2014 Jul 29.
9
Idiomarina halophila sp. nov., isolated from a solar saltern sediment.嗜盐海洋杆菌新种，从太阳能盐场沉积物中分离得到。
Int J Syst Evol Microbiol. 2015 Apr;65(Pt 4):1268-1273. doi: 10.1099/ijs.0.000094. Epub 2015 Jan 29.
10
Blastopirellula cremea sp. nov., isolated from a dead ark clam.厚壳贻贝芽孢杆菌（Blastopirellula cremea）sp. 新种，分离自一只死亡的贻贝。
Int J Syst Evol Microbiol. 2013 Jun;63(Pt 6):2314-2319. doi: 10.1099/ijs.0.044099-0. Epub 2012 Nov 16.

引用本文的文献

1
Genome Sequence of the Deep-Sea Bacterium Idiomarina abyssalis KMM 227T.深海细菌深渊海栖菌KMM 227T的基因组序列
Genome Announc. 2015 Oct 29;3(5):e01256-15. doi: 10.1128/genomeA.01256-15.

本文引用的文献

1
The Genomes On Line Database (GOLD) in 2009: status of genomic and metagenomic projects and their associated metadata.《基因组在线数据库（GOLD）》2009 年报告：基因组和宏基因组项目及其相关元数据的现状。
Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(Database issue):D346-54. doi: 10.1093/nar/gkp848. Epub 2009 Nov 13.
2
Pseudidiomarina marina sp. nov. and Pseudidiomarina tainanensis sp. nov. and reclassification of Idiomarina homiensis and Idiomarina salinarum as Pseudidiomarina homiensis comb. nov. and Pseudidiomarina salinarum comb. nov., respectively.海洋假海杆菌新种、台南假海杆菌新种以及将霍氏海杆菌和盐渍海杆菌分别重新分类为霍氏假海杆菌新组合和盐渍假海杆菌新组合。
Int J Syst Evol Microbiol. 2009 Jan;59(Pt 1):53-9. doi: 10.1099/ijs.0.001180-0.
3
The RAST Server: rapid annotations using subsystems technology.RAST服务器：使用子系统技术进行快速注释。
BMC Genomics. 2008 Feb 8;9:75. doi: 10.1186/1471-2164-9-75.
4
RNAmmer: consistent and rapid annotation of ribosomal RNA genes.RNAmmer：核糖体RNA基因的一致性快速注释
Nucleic Acids Res. 2007;35(9):3100-8. doi: 10.1093/nar/gkm160. Epub 2007 Apr 22.
5
Identifying bacterial genes and endosymbiont DNA with Glimmer.使用Glimmer识别细菌基因和内共生体DNA。
Bioinformatics. 2007 Mar 15;23(6):673-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btm009. Epub 2007 Jan 19.
6
Unique features revealed by the genome sequence of Acinetobacter sp. ADP1, a versatile and naturally transformation competent bacterium.不动杆菌ADP1的基因组序列揭示的独特特征，ADP1是一种具有多种功能且天然具备转化能力的细菌。
Nucleic Acids Res. 2004 Oct 28;32(19):5766-79. doi: 10.1093/nar/gkh910. Print 2004.
7
Idiomarina gen. nov., comprising novel indigenous deep-sea bacteria from the Pacific Ocean, including descriptions of two species, Idiomarina abyssalis sp. nov. and Idiomarina zobellii sp. nov.新属Idiomarina，包含来自太平洋的新型本土深海细菌，包括对两个物种的描述，深渊Idiomarina菌新种和佐贝尔Idiomarina菌新种。
Int J Syst Evol Microbiol. 2000 Mar;50 Pt 2:901-907. doi: 10.1099/00207713-50-2-901.
8
A genomic perspective on protein families.蛋白质家族的基因组视角。
Science. 1997 Oct 24;278(5338):631-7. doi: 10.1126/science.278.5338.631.
9
Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs.空位BLAST和位置特异性迭代BLAST：新一代蛋白质数据库搜索程序。
Nucleic Acids Res. 1997 Sep 1;25(17):3389-402. doi: 10.1093/nar/25.17.3389.
10
tRNAscan-SE: a program for improved detection of transfer RNA genes in genomic sequence.tRNAscan-SE：用于改进基因组序列中转运RNA基因检测的程序。
Nucleic Acids Res. 1997 Mar 1;25(5):955-64. doi: 10.1093/nar/25.5.955.

从韩国魁蛤中分离出的海洋细菌Idiomarina sp.菌株28-8的基因组序列

Genome Sequence of Marine Bacterium Idiomarina sp. Strain 28-8, Isolated from Korean Ark Shells.

作者信息

Kim Woo-Jin, Kim Young-Ok, Kim Dong-Gyun, Nam Bo-Hye, Kong Hee Jeong, Jung Hyungtaek, Lee Sang-Jun, Kim Dong-Wook, Kim Dae-Soo, Chae Sung-Hwa

机构信息

Biotechnology Research Division, National Fisheries Research and Development Institute (NFRDI), Busan, Republic of Korea.

出版信息

Genome Announc. 2013 Oct 3;1(5):e00772-13. doi: 10.1128/genomeA.00772-13.

DOI:10.1128/genomeA.00772-13
PMID:24092779
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3790083/
Abstract

Idiomarina sp. strain 28-8 is an aerobic, Gram-negative, flagellar bacterium isolated from the bodies of ark shells (Scapharca broughtonii) collected from underwater sediments in Gangjin Bay, South Korea. Here, we present the draft genome sequence of Idiomarina sp. 28-8 (2,971,606 bp, with a G+C content of 46.9%), containing 2,795 putative coding sequences.

摘要

海洋嗜盐菌属菌株28-8是一种需氧、革兰氏阴性、具鞭毛的细菌，从韩国康津湾水下沉积物中采集的魁蚶（Scapharca broughtonii）体内分离得到。在此，我们公布海洋嗜盐菌属菌株28-8的基因组草图序列（2,971,606 bp，G+C含量为46.9%），包含2,795个推定的编码序列。