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1
Occurrence in Mexico, 1998-2008, of Vibrio cholerae CTX+ El Tor carrying an additional truncated CTX prophage.1998-2008 年在墨西哥出现的携带额外截断 CTX 噬菌体的霍乱弧菌 CTX+El Tor。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Jul 8;111(27):9917-22. doi: 10.1073/pnas.1323408111. Epub 2014 Jun 23.
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Cholera between 1991 and 1997 in Mexico was associated with infection by classical, El Tor, and El Tor variants of Vibrio cholerae.1991 年至 1997 年期间墨西哥的霍乱与古典生物型、埃尔托生物型和埃尔托变异生物型霍乱弧菌感染有关。
J Clin Microbiol. 2010 Oct;48(10):3666-74. doi: 10.1128/JCM.00866-10. Epub 2010 Jul 28.
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Novel Cholera Toxin Variant and ToxT Regulon in Environmental Isolates: Potential Resources for the Evolution of Hybrid Strains.新型霍乱毒素变体和环境分离株中的 ToxT 调控子:杂交株进化的潜在资源。
Appl Environ Microbiol. 2019 Jan 23;85(3). doi: 10.1128/AEM.01977-18. Print 2019 Feb 1.
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Recent Vibrio cholerae O1 Epidemic Strains Are Unable To Replicate CTXΦ Prophage Genome.最近的霍乱弧菌 O1 流行株无法复制 CTXΦ 噬菌体基因组。
mSphere. 2021 Jun 30;6(3):e0033721. doi: 10.1128/mSphere.00337-21. Epub 2021 Jun 9.
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Genesis of variants of Vibrio cholerae O1 biotype El Tor: role of the CTXphi array and its position in the genome.霍乱弧菌O1生物型埃尔托变种的起源:CTXphi阵列的作用及其在基因组中的位置
Microbiology (Reading). 2003 Jan;149(Pt 1):89-97. doi: 10.1099/mic.0.25599-0.
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Genomic analysis of the Mozambique strain of Vibrio cholerae O1 reveals the origin of El Tor strains carrying classical CTX prophage.霍乱弧菌O1莫桑比克菌株的基因组分析揭示了携带经典CTX前噬菌体的埃尔托菌株的起源。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2007 Mar 20;104(12):5151-6. doi: 10.1073/pnas.0700365104. Epub 2007 Mar 12.
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CTX prophages in classical biotype Vibrio cholerae: functional phage genes but dysfunctional phage genomes.经典生物型霍乱弧菌中的CTX噬菌体:功能性噬菌体基因但功能失调的噬菌体基因组
J Bacteriol. 2000 Dec;182(24):6992-8. doi: 10.1128/JB.182.24.6992-6998.2000.
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Phylogenetic Diversity of Vibrio cholerae Associated with Endemic Cholera in Mexico from 1991 to 2008.1991年至2008年墨西哥地方性霍乱相关霍乱弧菌的系统发育多样性
mBio. 2016 Mar 15;7(2):e02160. doi: 10.1128/mBio.02160-15.
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Drug response and genetic properties of Vibrio cholerae associated with endemic cholera in north-eastern Thailand, 2003-2011.2003-2011 年泰国东北部地方性霍乱中与霍乱弧菌相关的药物反应和遗传特性。
J Med Microbiol. 2013 Apr;62(Pt 4):599-609. doi: 10.1099/jmm.0.053801-0. Epub 2013 Jan 14.
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Molecular analysis of the rstR and orfU genes of the CTX prophages integrated in the small chromosomes of environmental Vibrio cholerae non-O1, non-O139 strains.整合于环境中非O1、非O139型霍乱弧菌小染色体上的CTX噬菌体的rstR和orfU基因的分子分析。
Environ Microbiol. 2006 Mar;8(3):526-634. doi: 10.1111/j.1462-2920.2005.00932.x.

引用本文的文献

1
Vibrio cholerae O1 El Tor strains linked to global cholera show region-specific patterns by pulsed-field gel electrophoresis.埃尔托弧菌 O1 霍乱菌株通过脉冲场凝胶电泳显示出与全球霍乱相关的特定区域模式。
Infect Genet Evol. 2022 Nov;105:105363. doi: 10.1016/j.meegid.2022.105363. Epub 2022 Sep 8.
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Population Structure and Multidrug Resistance of Non-O1/Non-O139 Vibrio cholerae in Freshwater Rivers in Zhejiang, China.中国浙江淡水河流中非 O1/非 O139 霍乱弧菌的种群结构和多重耐药性。
Microb Ecol. 2021 Aug;82(2):319-333. doi: 10.1007/s00248-020-01645-z. Epub 2021 Jan 7.
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Revisiting the Global Epidemiology of Cholera in Conjuction With the Genomics of .结合……的基因组学重新审视霍乱的全球流行病学
Front Public Health. 2019 Jul 23;7:203. doi: 10.3389/fpubh.2019.00203. eCollection 2019.
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Season-Specific Occurrence of Potentially Pathogenic Vibrio spp. on the Southern Coast of South Korea.韩国南部海岸潜在致病性弧菌属的季节性发生情况。
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Comparison of DOT-ELISA and Standard-ELISA for Detection of the Vibrio cholerae Toxin in Culture Supernatants of Bacteria Isolated from Human and Environmental Samples.用于检测从人类和环境样本中分离出的细菌培养上清液中霍乱弧菌毒素的斑点酶联免疫吸附测定法(DOT-ELISA)与标准酶联免疫吸附测定法(Standard-ELISA)的比较。
Indian J Microbiol. 2016 Sep;56(3):379-82. doi: 10.1007/s12088-016-0596-2. Epub 2016 May 27.
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mBio. 2016 Mar 15;7(2):e02160. doi: 10.1128/mBio.02160-15.
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Multidrug resistant Vibrio cholerae O1 from clinical and environmental samples in Kathmandu city.来自加德满都临床和环境样本的多重耐药性霍乱弧菌O1
BMC Infect Dis. 2015 Feb 27;15:104. doi: 10.1186/s12879-015-0844-9.

本文引用的文献

1
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Environ Microbiol Rep. 2011 Dec;3(6):783-90. doi: 10.1111/j.1758-2229.2011.00287.x. Epub 2011 Sep 19.
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Phenotypic, genotypic, and antibiotic sensitivity patterns of strains isolated from the cholera epidemic in Zimbabwe.津巴布韦霍乱疫情中分离株的表型、基因型和抗生素敏感性模式。
J Clin Microbiol. 2011 Jun;49(6):2325-7. doi: 10.1128/JCM.00432-11. Epub 2011 Apr 6.
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N Engl J Med. 2011 Jan 6;364(1):33-42. doi: 10.1056/NEJMoa1012928. Epub 2010 Dec 9.
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Characterization of novel alleles of toxin co-regulated pilus A gene (tcpA) from environmental isolates of Vibrio cholerae.从环境分离的霍乱弧菌中鉴定新型毒素共调节菌毛 A 基因(tcpA)的等位基因。
Curr Microbiol. 2011 Mar;62(3):758-63. doi: 10.1007/s00284-010-9774-3. Epub 2010 Oct 22.
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J Clin Microbiol. 2010 Oct;48(10):3666-74. doi: 10.1128/JCM.00866-10. Epub 2010 Jul 28.
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El Tor cholera with severe disease: a new threat to Asia and beyond.埃尔托霍乱伴严重疾病:对亚洲及其他地区的新威胁。
Epidemiol Infect. 2010 Mar;138(3):347-52. doi: 10.1017/S0950268809990550. Epub 2009 Aug 14.

1998-2008 年在墨西哥出现的携带额外截断 CTX 噬菌体的霍乱弧菌 CTX+El Tor。

Occurrence in Mexico, 1998-2008, of Vibrio cholerae CTX+ El Tor carrying an additional truncated CTX prophage.

机构信息

International Center for Diarrheal Disease Research, Bangladesh (icddr,b), Mohakhali, Dhaka 1212, Bangladesh;

Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, 22860 Ensenada, Baja California, Mexico;

出版信息

Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Jul 8;111(27):9917-22. doi: 10.1073/pnas.1323408111. Epub 2014 Jun 23.

DOI:10.1073/pnas.1323408111
PMID:24958870
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4103378/
Abstract

The seventh cholera pandemic caused by Vibrio cholerae O1 El Tor (ET) has been superseded in Asia and Africa by altered ET possessing the cholera toxin (CTX) gene of classical (CL) biotype. The CL biotype of V. cholerae was isolated, along with prototypic and altered ET, during the 1991 cholera epidemic in Mexico and subsequently remained endemic until 1997. Microbiological, molecular, and phylogenetic analyses of clinical and environmental V. cholerae isolated in Mexico between 1998 and 2008 revealed important genetic events favoring predominance of ET over CL and altered ET. V. cholerae altered ET was predominant after 1991 but not after 2000. V. cholerae strains isolated between 2001 and 2003 and a majority isolated in 2004 lacked CTX prophage (Φ) genes encoding CTX subunits A and B and repeat sequence transcriptional regulators of ET and CL biotypes: i.e., CTXΦ(-). Most CTXΦ(-) V. cholerae isolated in Mexico between 2001 and 2003 also lacked toxin coregulated pili tcpA whereas some carried either tcpA(ET) or a variant tcpA with noticeable sequence dissimilarity from tcpA(CL). The tcpA variants were not detected in 2005 after CTXΦ(+) ET became dominant. All clinical and environmental V. cholerae O1 strains isolated during 2005-2008 in Mexico were CTXΦ(+) ET, carrying an additional truncated CTXΦ instead of RS1 satellite phage. Despite V. cholerae CTXΦ(-) ET exhibiting heterogeneity in pulsed-field gel electrophoresis patterns, CTXΦ(+) ET isolated during 2004-2008 displayed homogeneity and clonal relationship with V. cholerae ET N16961 and V. cholerae ET isolated in Peru.

摘要

由霍乱弧菌 O1 型 El Tor (ET) 引起的第七次霍乱大流行已在亚洲和非洲被具有经典 (CL) 生物型霍乱毒素 (CTX) 基因的变异 ET 取代。1991 年墨西哥霍乱流行期间分离出了 CL 生物型霍乱弧菌,以及原型和变异 ET,并随后一直流行至 1997 年。1998 年至 2008 年期间,对墨西哥分离出的临床和环境中霍乱弧菌的微生物学、分子和系统发育分析显示,有利于 ET 取代 CL 和变异 ET 的重要遗传事件。1991 年后,ET 成为优势菌,但 2000 年后并非如此。2001 年至 2003 年期间分离出的霍乱弧菌菌株以及 2004 年多数分离出的霍乱弧菌菌株均缺乏编码 CTX 亚单位 A 和 B 的 CTX 前噬菌体 (Φ) 基因以及 ET 和 CL 生物型的重复序列转录调控因子:即 CTXΦ(-)。2001 年至 2003 年期间在墨西哥分离出的大多数 CTXΦ(-)霍乱弧菌也缺乏毒素调节性菌毛 tcpA,而一些菌株携带 tcpA(ET)或与 tcpA(CL)具有明显序列差异的变体 tcpA。2005 年 CTXΦ(+) ET 成为优势菌后,未检测到 tcpA 变体。2005-2008 年期间在墨西哥分离出的所有临床和环境 O1 型霍乱弧菌菌株均为 CTXΦ(+) ET,携带额外的截短 CTXΦ,而不是 RS1 卫星噬菌体。尽管 CTXΦ(-) ET 霍乱弧菌在脉冲场凝胶电泳图谱上表现出异质性,但 2004-2008 年期间分离出的 CTXΦ(+) ET 与秘鲁分离出的 V. cholerae ET N16961 和 V. cholerae ET 具有同源性和克隆关系。