• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

电子断层扫描中的标记检测:一项比较研究。

Marker Detection in Electron Tomography: A Comparative Study.

作者信息

Trampert Patrick, Bogachev Sviatoslav, Marniok Nico, Dahmen Tim, Slusallek Philipp

机构信息

1German Research Center for Artificial Intelligence GmbH (DFKI),66123 Saarbrücken,Germany.

2Saarland University,66123 Saarbrücken,Germany.

出版信息

Microsc Microanal. 2015 Dec;21(6):1591-1601. doi: 10.1017/S1431927615015433. Epub 2015 Nov 25.

DOI:10.1017/S1431927615015433
PMID:26601573
Abstract

We conducted a comparative study of three widely used algorithms for the detection of fiducial markers in electron microscopy images. The algorithms were applied to four datasets from different sources. For the purpose of obtaining comparable results, we introduced figures of merit and implemented all three algorithms in a unified code base to exclude software-specific differences. The application of the algorithms revealed that none of the three algorithms is superior to the others in all cases. This leads to the conclusion that the choice of a marker detection algorithm highly depends on the properties of the dataset to be analyzed, even within the narrowed domain of electron tomography.

摘要

我们对三种广泛用于检测电子显微镜图像中基准标记的算法进行了比较研究。这些算法被应用于来自不同来源的四个数据集。为了获得可比的结果,我们引入了品质因数,并在统一的代码库中实现了所有三种算法,以排除软件特定的差异。算法的应用表明,在所有情况下,这三种算法都不优于其他算法。由此得出结论,即使在电子断层扫描这个较窄的领域内,标记检测算法的选择也高度依赖于待分析数据集的属性。

相似文献

1
Marker Detection in Electron Tomography: A Comparative Study.电子断层扫描中的标记检测:一项比较研究。
Microsc Microanal. 2015 Dec;21(6):1591-1601. doi: 10.1017/S1431927615015433. Epub 2015 Nov 25.
2
An automatic method of detecting and tracking fiducial markers for alignment in electron tomography.一种用于电子断层扫描中对齐的基准标记检测与跟踪的自动方法。
J Electron Microsc (Tokyo). 2011;60(1):39-46. doi: 10.1093/jmicro/dfq076. Epub 2010 Nov 12.
3
Fiducial-less alignment of cryo-sections.冷冻切片的无基准对齐
J Struct Biol. 2007 Sep;159(3):413-23. doi: 10.1016/j.jsb.2007.04.014. Epub 2007 Jun 9.
4
Markov random field based automatic image alignment for electron tomography.基于马尔可夫随机场的电子断层扫描自动图像配准
J Struct Biol. 2008 Mar;161(3):260-75. doi: 10.1016/j.jsb.2007.07.007. Epub 2007 Jul 28.
5
Reprint of "Fiducial-less alignment of cryo-sections" [J. Struct. Biol. 159 (2007) 413-423].
J Struct Biol. 2008 Mar;161(3):249-59. doi: 10.1016/S1047-8477(08)00060-9.
6
Refinement procedure for the image alignment in high-resolution electron tomography.高分辨率电子断层扫描中图像配准的细化过程。
Ultramicroscopy. 2011 Aug-Oct;111(9-10):1512-20. doi: 10.1016/j.ultramic.2011.06.001. Epub 2011 Jun 21.
7
GREIT: a unified approach to 2D linear EIT reconstruction of lung images.GREIT:一种用于肺部图像二维线性电阻抗断层成像重建的统一方法。
Physiol Meas. 2009 Jun;30(6):S35-55. doi: 10.1088/0967-3334/30/6/S03. Epub 2009 Jun 2.
8
XMIPP: a new generation of an open-source image processing package for electron microscopy.XMIPP:新一代用于电子显微镜的开源图像处理软件包。
J Struct Biol. 2004 Nov;148(2):194-204. doi: 10.1016/j.jsb.2004.06.006.
9
Implementation of fiducial-based image registration in the Cyberknife robotic system.在射波刀机器人系统中基于基准点的图像配准的实现。
Med Dosim. 2008 Summer;33(2):156-60. doi: 10.1016/j.meddos.2008.03.002. Epub 2008 Mar 31.
10
A marker-free automatic alignment method based on scale-invariant features.一种基于尺度不变特征的无标记自动对齐方法。
J Struct Biol. 2014 Apr;186(1):167-80. doi: 10.1016/j.jsb.2014.02.011. Epub 2014 Feb 27.

引用本文的文献

1
A fast fiducial marker tracking model for fully automatic alignment in electron tomography.一种快速的特征标记跟踪模型,用于电子断层扫描中的全自动配准。
Bioinformatics. 2018 Mar 1;34(5):853-863. doi: 10.1093/bioinformatics/btx653.