SED-ML网络工具：生成、修改和导出符合标准的模拟研究。
SED-ML web tools: generate, modify and export standard-compliant simulation studies.
作者信息
Bergmann Frank T, Nickerson David, Waltemath Dagmar, Scharm Martin
机构信息
COS/BioQUANT, Heidelberg University, Heidelberg, Germany.
Auckland Bioengineering Institute, University of Auckland, Auckland, New Zealand.
出版信息
Bioinformatics. 2017 Apr 15;33(8):1253-1254. doi: 10.1093/bioinformatics/btw812.
Abstract
SUMMARY
The Simulation Experiment Description Markup Language (SED-ML) is a standardized format for exchanging simulation studies independently of software tools. We present the SED-ML Web Tools, an online application for creating, editing, simulating and validating SED-ML documents. The Web Tools implement all current SED-ML specifications and, thus, support complex modifications and co-simulation of models in SBML and CellML formats. Ultimately, the Web Tools lower the bar on working with SED-ML documents and help users create valid simulation descriptions.
AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION
http://sysbioapps.dyndns.org/SED-ML_Web_Tools/ .
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摘要
摘要
模拟实验描述标记语言（SED-ML）是一种独立于软件工具来交换模拟研究的标准化格式。我们展示了SED-ML网络工具，这是一个用于创建、编辑、模拟和验证SED-ML文档的在线应用程序。该网络工具实现了所有当前的SED-ML规范，因此支持对SBML和CellML格式模型的复杂修改和协同模拟。最终，网络工具降低了使用SED-ML文档的难度，并帮助用户创建有效的模拟描述。
可用性和实现方式
http://sysbioapps.dyndns.org/SED-ML_Web_Tools/ 。
联系方式
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