Suppr超能文献

蛋白质生物信息学数据库与资源

Protein Bioinformatics Databases and Resources.

作者信息

Chen Chuming, Huang Hongzhan, Wu Cathy H

机构信息

Center for Bioinformatics and Computational Biology, University of Delaware, Newark, DE, 19711, USA.

Center for Bioinformatics and Computational Biology, Department of Computer and Information Sciences, University of Delaware, Newark, DE, 19711, USA.

出版信息

Methods Mol Biol. 2017;1558:3-39. doi: 10.1007/978-1-4939-6783-4_1.

Abstract

Many publicly available data repositories and resources have been developed to support protein-related information management, data-driven hypothesis generation, and biological knowledge discovery. To help researchers quickly find the appropriate protein-related informatics resources, we present a comprehensive review (with categorization and description) of major protein bioinformatics databases in this chapter. We also discuss the challenges and opportunities for developing next-generation protein bioinformatics databases and resources to support data integration and data analytics in the Big Data era.

摘要

为支持蛋白质相关信息管理、数据驱动的假设生成和生物学知识发现,已开发了许多公开可用的数据存储库和资源。为帮助研究人员快速找到合适的蛋白质相关信息学资源,我们在本章对主要蛋白质生物信息学数据库进行了全面综述(包括分类和描述)。我们还讨论了在大数据时代开发下一代蛋白质生物信息学数据库和资源以支持数据集成和数据分析所面临的挑战与机遇。

相似文献

1
Protein Bioinformatics Databases and Resources.蛋白质生物信息学数据库与资源
Methods Mol Biol. 2017;1558:3-39. doi: 10.1007/978-1-4939-6783-4_1.
2
Protein bioinformatics databases and resources.蛋白质生物信息学数据库与资源。
Methods Mol Biol. 2011;694:3-24. doi: 10.1007/978-1-60761-977-2_1.
3
Useful Web Resources.有用的网络资源。
Adv Exp Med Biol. 2016;919:249-253. doi: 10.1007/978-3-319-41448-5_14.
5
The Evolution of Soybean Knowledge Base (SoyKB).大豆知识库(SoyKB)的发展历程。
Methods Mol Biol. 2017;1533:149-159. doi: 10.1007/978-1-4939-6658-5_7.
7
The Bio-Analytic Resource for Plant Biology.植物生物学的生物分析资源。
Methods Mol Biol. 2017;1533:119-148. doi: 10.1007/978-1-4939-6658-5_6.
10
Proteotypic Peptides and Their Applications.原型肽及其应用。
Methods Mol Biol. 2017;1549:101-107. doi: 10.1007/978-1-4939-6740-7_8.

引用本文的文献

本文引用的文献

1
KEGG as a reference resource for gene and protein annotation.KEGG作为基因和蛋白质注释的参考资源。
Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D457-62. doi: 10.1093/nar/gkv1070. Epub 2015 Oct 17.
8
PhosphoSitePlus, 2014: mutations, PTMs and recalibrations.磷酸化位点Plus,2014:突变、翻译后修饰与重新校准。
Nucleic Acids Res. 2015 Jan;43(Database issue):D512-20. doi: 10.1093/nar/gku1267. Epub 2014 Dec 16.

文献AI研究员

20分钟写一篇综述,助力文献阅读效率提升50倍。

立即体验

用中文搜PubMed

大模型驱动的PubMed中文搜索引擎

马上搜索

文档翻译

学术文献翻译模型,支持多种主流文档格式。

立即体验