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3DBIONOTES v2.0:一个用于自动注释大分子结构的网络服务器。

3DBIONOTES v2.0: a web server for the automatic annotation of macromolecular structures.

机构信息

GN7 of the Spanish National Institute for Bioinformatics (INB), Biocomputing Unit, National Center of Biotechnology (CSIC), Instruct Image Processing Center, Madrid 28049, Spain.

出版信息

Bioinformatics. 2017 Nov 15;33(22):3655-3657. doi: 10.1093/bioinformatics/btx483.

Abstract

MOTIVATION

Complementing structural information with biochemical and biomedical annotations is a powerful approach to explore the biological function of macromolecular complexes. However, currently the compilation of annotations and structural data is a feature only available for those structures that have been released as entries to the Protein Data Bank.

RESULTS

To help researchers in assessing the consistency between structures and biological annotations for structural models not deposited in databases, we present 3DBIONOTES v2.0, a web application designed for the automatic annotation of biochemical and biomedical information onto macromolecular structural models determined by any experimental or computational technique.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

The web server is available at http://3dbionotes-ws.cnb.csic.es.

CONTACT

jsegura@cnb.csic.es.

SUPPLEMENTARY INFORMATION

Supplementary data are available at Bioinformatics online.

摘要

动机

用生化和生物医学注释来补充结构信息是一种探索生物大分子复合物的生物学功能的有力方法。然而,目前注释和结构数据的编纂仅适用于那些已作为蛋白质数据库条目发布的结构。

结果

为了帮助研究人员评估未在数据库中存储的结构模型的结构和生物注释之间的一致性,我们提出了 3DBIONOTES v2.0,这是一个网络应用程序,旨在为通过任何实验或计算技术确定的生物大分子结构模型自动注释生化和生物医学信息。

可用性和实现

该网络服务器可在 http://3dbionotes-ws.cnb.csic.es 获得。

联系信息

jsegura@cnb.csic.es

补充信息

补充数据可在生物信息学在线获得。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b1f4/5870569/170734b1d665/btx483f1.jpg

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