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利用基于 CRISPR 的筛选技术鉴定新型增强子元件

Identifying Novel Enhancer Elements with CRISPR-Based Screens.

机构信息

Department of Genome Sciences, University of Washington , Seattle, Washington 98195, United States.

Molecular Engineering & Science Institute, University of Washington , Seattle, Washington 98195, United States.

出版信息

ACS Chem Biol. 2018 Feb 16;13(2):326-332. doi: 10.1021/acschembio.7b00778. Epub 2018 Jan 10.

Abstract

Enhancers control the spatiotemporal expression of genes and are essential for encoding differentiation and development. Since their discovery more than three decades ago, researchers have largely studied enhancers removed from their genomic context. The recent adaptation of CRISPR/Cas9 to genome editing in higher organisms now allows researchers to perturb and test these elements in their genomic context, through both mutation and epigenetic modulation. In this Perspective, we discuss recent advances in scanning noncoding regions of the genome for enhancer activity using CRISPR-based tools.

摘要

增强子控制基因的时空表达,对于编码分化和发育至关重要。自三十多年前发现以来,研究人员主要研究了从基因组背景中去除的增强子。最近,CRISPR/Cas9 被成功应用于高等生物的基因组编辑,这使得研究人员能够通过突变和表观遗传调控,在基因组背景中干扰和测试这些元件。在本文中,我们讨论了利用基于 CRISPR 的工具扫描基因组中非编码区域的增强子活性的最新进展。

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